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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003115`

染色体: Chr01 坐标: 49957646-49959019 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003115`
名称	SmilChr01G003115
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49957646 - 49959019 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009444`
GeneID	`131009444`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009444`
原始查询	`LOC131009444`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=35.3; qcov=0.186; evalue=1.47e-09; confidence=weak
Rice	`Os06g0330100` (Pid3) - identity=27.4; qcov=0.567; evalue=1.3e-12; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009444

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792751.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057792751.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792751.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792751.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792751.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49957808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B18,B40
`Chr1:49957821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:49957836`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	B134,B14,B4,B51,B57,B60,B61,B89,B95,C31,C53,C70,C76,D10,D8,D9
`Chr1:49957962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:49957965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49958049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49958053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49958125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49958219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B79,C47,C76
`Chr1:49958262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B79,C47,C76
`Chr1:49958329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C45
`Chr1:49958339`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B19,B2,B30,B42,B43,B52,B54,B71,B91,C4,C54,C55,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792751.1

457 aa

228

457

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 3-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792751.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	3	74	6.2e-14	52.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936768.1
ATGGGAGTTTTTGAGGAAGACTGCGTAGTTCGCGTCTCAGCACTCATCAAATTATGGGTTTCTGAAGGATTTCTAAGACCAGTAAGTGGCAAAAGCTTGGAAACAACTGCAAAAGAGTACTACTTACACGACCTAGTTGAAAGAAACCTCATTCTAGTTCACGAATTAGGGTCTACCGGAAACATAAAGTTGTGCAAAATTCATAATCTTCTAAGAGATGTTTTGTGGAGAGAAGCCGAGAAAGAGGGCTTTTACAATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009444
ATGGGAGTTTTTGAGGAAGACTGCGTAGTTCGCGTCTCAGCACTCATCAAATTATGGGTTTCTGAAGGATTTCTAAGACCAGTAAGTGGCAAAAGCTTGGAAACAACTGCAAAAGAGTACTACTTACACGACCTAGTTGAAAGAAACCTCATTCTAGTTCACGAATTAGGGTCTACCGGAAACATAAAGTTGTGCAAAATTCATAATCTTCTAAGAGATGTTTTGTGGAGAGAAGCCGAGAAAGAGGGCTTTTACAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792751.1
MGVFEEDCVVRVSALIKLWVSEGFLRPVSGKSLETTAKEYYLHDLVERNLILVHELGSTGNIKLCKIHNLLRDVLWREAEKEGFYNVMGQFKFQGLKGKRRVVITRSTSKKEADDALQRLPLARSVVCHNKEIQPLPKSRLLRTLKSYDRDAYGSHDYLLDDLIRFVNPRYLAVGVDKEFQFTSSFNLLWNVQTIIILCSTCVCAPYQVWDQMPQLKHVEFHKEDLYLPIPQKRKIVAMKNLQTLKGVCFSMIDKTTLSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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