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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005494`

染色体: Chr02 坐标: 75097484-75099333 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005494`
名称	SmilChr02G005494
描述	scarecrow-like protein 23
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75097484 - 75099333 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009456`
GeneID	`131009456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009456`
原始查询	`LOC131009456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 23
产物	scarecrow-like protein 23
Arabidopsis	`AT5G41920` (AT5G41920) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834197] identity=65.6; qcov=0.847; evalue=1.54e-170; confidence=high
Rice	`Os07g0567700` - identity=69.4; qcov=0.819; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0048366 (leaf development); GO:0090610 (bundle sheath cell fate specification)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792767.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792767.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057792767.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792767.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75097697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B76,C32,C39,C68,C85
`Chr2:75097705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B2,B72,C51
`Chr2:75097796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,C26,C46,C70
`Chr2:75097811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B64,C11,C69
`Chr2:75097831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:75097850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C46,C70
`Chr2:75097886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr2:75097950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C42
`Chr2:75097955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B56,B96,C55
`Chr2:75097989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr2:75098015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B51,B93
`Chr2:75098036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792767.1

443 aa

222

443

GRAS

PF03514 GRAS 81-440 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792767.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	81	440	3.3e-113	379.1	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936784.1
AAAAACAAAAGATTCGAACCACAACCTCATTATATATGACTCACAGCCGATCATAGCTCACCAAATTTGGTCAATGATCTAACCTCATTTTTTTTTTACTATAATCACATATAAAATTCGACACCACCACCTTATTACCTTATTTAATACCTACATACTGAATCATCATCAAATTCTTAGATAAATCCCAAAAATAAAATAAATAAAAAAAGTGAATTAATTTCACCCCACAATCATTTATTTCTGCGCCTCACAAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009456
ATGCTCCACTCCCTCCTCCACTCCACCCCCTCCTCCTCCGCCGCCTCCGCCGCCATGTCCTCCGCCGGCAAACGCCCCGTTGACCCCGCCCCCCTCAAGCGCCCCCGCCCCCAATCCTCCGACAACGACGACGAAGATGACGAGGAAGACGAAGACGAAGAAAGCAATCCACTCGCGCCGGCGCCGGCGCCGGCCCCCCCCACCGGCCCCCCCGACCCCGACTCCACGGGGCTCCGCCTCCTCAGCCTCCTCCTCCAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792767.1
MLHSLLHSTPSSSAASAAMSSAGKRPVDPAPLKRPRPQSSDNDDEDDEEDEDEESNPLAPAPAPAPPTGPPDPDSTGLRLLSLLLQCAECVAVDNLDDAGQLLPEIAELSSPFGSSAQRVGAYFADALSARIISSFLGTYAPLSPPSKSHHHNQLLNALQIYNSITPLIKFSHFTANQAIQLALDGADHVHVIDLDIMQGLQWPGLFHILASKNKKIKSFRITGLGPSAELLNSTGRRLSEFAAALNIPFEFQPLEGKIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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