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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005509`

染色体: Chr02 坐标: 75203472-75204737 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005509`
名称	SmilChr02G005509
描述	receptor-like protein EIX1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75203472 - 75204737 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009473`
GeneID	`131009473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009473`
原始查询	`LOC131009473`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein EIX1
产物	receptor-like protein EIX1
Arabidopsis	`AT4G13880` (RLP48) receptor like protein 48 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827022] identity=48.9; qcov=0.606; evalue=1.71e-22; confidence=medium
Rice	`Os11g0564900` - identity=51.6; qcov=0.587; evalue=1.09e-21; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057792800.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057792800.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057792800.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057792800.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792800.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75203929`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A25,A4,B139,B73,B96,B97,C16,C23,C7,C9
`Chr2:75203934`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A25,A4,B139,B73,B96,B97,C16,C23,C7,C9
`Chr2:75203964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,C1,C70,C73
`Chr2:75204067`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A15,C58
`Chr2:75204067`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A15,C58
`Chr2:75204070`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A15,C58
`Chr2:75204070`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A15,C58
`Chr2:75204108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B53,C58
`Chr2:75204130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B53,C58
`Chr2:75204187`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A11,A14,A21,A23,A6,B104,B110,B113,B121,B128,B130,B132,B14,B22,B35,B50,B52,B55,B72,B77,B8,B83,B86,C13,C14,C21,C23,C25,C36,C4,C46,C49,C61,C70,C76,D11
`Chr2:75204337`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A2
`Chr2:75204337`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792800.1

155 aa

155

LRR_1

PF00560 LRR_1 4-24 aa PF00560 LRR_1 28-49 aa PF00560 LRR_1 52-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792800.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	4	24	1.6e-11	42.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057792800.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	28	49	1.6e-11	42.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057792800.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	52	69	1.6e-11	42.7	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936817.1
TGAAATAAGTTGCAGCCATAGAGAAATGATTAGAGGTTAGGAGAAGAAAATAGGCCGTAGAAGTTCATTTTTTGATCTTTATTGGAATTTCTTTAATTTGTTGATCAATAAATCTCCTCCGATTGACTCTCCCGTGGATGTAGGCGAAAGCCGAACCACGTAAATTCATGTGTTCTTGTTTGATTTACTTTCGTTTATCATTATCGCATTGCAATTAATTTATTTGGAAATTAATATCGATTATCATTTTCTAATTTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009473
ATGCAGAGATTAATTTGTTTGAACCTATCAAGAAATAGTTTGACAGGAAATATAATTGGAGATATTGGTGAGATGGAGATGTTGGAATGCCTTGATCTATCACAGAACCACCTCTCGGGTAAAATACCAACAAGCTTTACCCAATTAAATTTCTTAACCTTTCTTAATTTGTCGAGCAACGGTTTGTCTGGAAAAATTCCAACGAGTACTCAACTTCAGAGCTTCAACGCATCTGTTTATGCCGAGAATGATGGACTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792800.1
MQRLICLNLSRNSLTGNIIGDIGEMEMLECLDLSQNHLSGKIPTSFTQLNFLTFLNLSSNGLSGKIPTSTQLQSFNASVYAENDGLCGAPLASRPEDSLKYRGGQVHGYKKKGGIKEGLSHKVMKSLRTKLQTMFRRKKKGGRTIAYKYSPIMCL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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