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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005514`

染色体: Chr02 坐标: 75249826-75250871 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005514`
名称	SmilChr02G005514
描述	receptor-like protein EIX2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75249826 - 75250871 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009478`
GeneID	`131009478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009478`
原始查询	`LOC131009478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein EIX2
产物	receptor-like protein EIX2
Arabidopsis	`AT2G33020` (RLP24) receptor like protein 24 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817864] identity=34.9; qcov=0.876; evalue=1.72e-32; confidence=low
Rice	`Os10g0375400` - identity=39.1; qcov=0.904; evalue=1.84e-42; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057792806.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792806.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792806.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792806.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792806.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75250193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:75250214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:75250246`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B104,B117,B62,B63,B79,C20,C43,C81
`Chr2:75250260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A23,B108,B35,B65
`Chr2:75250262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C20
`Chr2:75250271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C20
`Chr2:75250314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:75250329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:75250346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C45
`Chr2:75250371`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	77	A21,A24,A25,A4,A8,B101,B106,B107,B11,B112,B114,B118,B122,B125,B131,B18,B21,B30,B36,B39,B40,B41,B45,B47,B51,B54,B56,B59,B6,B60,B68,B69,B74,B77,B8,B85,B86,B88,B9,B91,B96,B97,B98,C10,C13,C16,C17,C19,C2,C21,C22,C27,C32,C33,C34,C36,C4,C40,C41,C43,C44,C48,C49,C52,C53,C56,C61,C63,C64,C65,C74,C75,C82,C85,D3,D6,D8
`Chr2:75250375`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	77	A21,A24,A25,A4,A8,B101,B106,B107,B11,B112,B114,B118,B122,B125,B131,B18,B21,B30,B36,B39,B40,B41,B45,B47,B51,B54,B56,B59,B6,B60,B68,B69,B74,B77,B8,B85,B86,B88,B9,B91,B96,B97,B98,C10,C13,C16,C17,C19,C2,C21,C22,C27,C32,C33,C34,C36,C4,C40,C41,C43,C44,C48,C49,C52,C53,C56,C61,C63,C64,C65,C74,C75,C82,C85,D3,D6,D8
`Chr2:75250418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792806.1

249 aa

124

249

LRR_1

PF00560 LRR_1 54-75 aa PF00560 LRR_1 78-98 aa PF00560 LRR_1 102-123 aa PF00560 LRR_1 126-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792806.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	54	75	4.2e-14	50.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057792806.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	78	98	4.2e-14	50.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057792806.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	102	123	4.2e-14	50.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057792806.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	126	143	4.2e-14	50.4	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936823.1
TTTGTCGGGGAAAATACATAATTGCTTCAACAATTTTACTGCATTGGCACAGATGAATACCACACAAGCTGATCCATATTCTCTTTTTGGTTATTACTTCATGATCCAATACAATAGTGATCTTCCAAATAACGAAATTCGACGTGTCTATGAATATTCGGCAATTCAATGGAAAGGTCGAGAATCGGAATATAGGAAAAATCTTAGGCTTCTCAAACTCATTGATTTTTCAAGCAATAGATTGACCGGAAACATTCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009478
ATGAATACCACACAAGCTGATCCATATTCTCTTTTTGGTTATTACTTCATGATCCAATACAATAGTGATCTTCCAAATAACGAAATTCGACGTGTCTATGAATATTCGGCAATTCAATGGAAAGGTCGAGAATCGGAATATAGGAAAAATCTTAGGCTTCTCAAACTCATTGATTTTTCAAGCAATAGATTGACCGGAAACATTCCCAAATCATTTTCCAGTATGCTTGGATTAATTTCCTTGAACCTATCAAGGAATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792806.1
MNTTQADPYSLFGYYFMIQYNSDLPNNEIRRVYEYSAIQWKGRESEYRKNLRLLKLIDFSSNRLTGNIPKSFSSMLGLISLNLSRNSLTGNIIRDIGEMEMLECVDLSHNQFSGELPTSLAQLQYLAVLDLSNNDLFGKIPTSTQLQSFDASAYAKNDGLCGAPLGALCPEDSLRPSIPNQNEKDDGNLSFMQEVCISLAFGFIFGFWGVIGSFIVKKSWRIAYFNFWDAVGDWFYVRIAMFISKWRRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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