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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005546`

染色体: Chr02 坐标: 75453517-75455925 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005546`
名称	SmilChr02G005546
描述	myb family transcription factor PHL8-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75453517 - 75455925 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009507`
GeneID	`131009507`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009507`
原始查询	`LOC131009507`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	myb family transcription factor PHL8-like
产物	myb family transcription factor PHL8-like
Arabidopsis	`AT4G04605` (AT4G04605) Myb-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719575] identity=54.5; qcov=0.418; evalue=1.27e-25; confidence=low
Rice	`Os06g0670300` (OsMPH1) - identity=59.7; qcov=0.391; evalue=4.55e-26; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009507

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792869.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792869.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792869.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792869.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75453666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr2:75453691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B133,B4,C77
`Chr2:75453700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B117,B55,C23,C41
`Chr2:75453703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C42
`Chr2:75453711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr2:75454778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75455296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B46
`Chr2:75455308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:75455769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,B56,B96,D7
`Chr2:75455782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75455806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792869.1

184 aa

184

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 20-71 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792869.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	20	71	4.9e-08	33.7	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936886.1
TCAAACCTATATCAACGAATTTCATCACATTACACTATTCAAACCATAATAACAATTTTGTTGTTTTTTTTTATTAGGTATTTTTCTACAATAGAAATGGATAATTATGAGAAAGCGAGGGTTATTAGACCGTACAGAAAATCGTCTCTTCCTCGCCTGCGATGGACACCTGACCTTCACAATCACTTCGTTGAAGTAGTTCATAGTCTTGGTGGGAAATACAAAGCAACTCCAAAGAAGATTATGCAGGTGATGGGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009507
ATGGATAATTATGAGAAAGCGAGGGTTATTAGACCGTACAGAAAATCGTCTCTTCCTCGCCTGCGATGGACACCTGACCTTCACAATCACTTCGTTGAAGTAGTTCATAGTCTTGGTGGGAAATACAAAGCAACTCCAAAGAAGATTATGCAGGTGATGGGCGTGAAGGGGCTCAAGATATCTCACATCAAGAGTCATCTACAGATGTACAGAAGCATGAGGGAAACCACAATTACAAACGAGTTTATAGCTGTGAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792869.1
MDNYEKARVIRPYRKSSLPRLRWTPDLHNHFVEVVHSLGGKYKATPKKIMQVMGVKGLKISHIKSHLQMYRSMRETTITNEFIAVKNYQEKRQVYEVMREAPTHRNLFRVPLTCQVRRRITQKGTNVILHEYRGDAQGSSSSEIKPGANMEIQTTTEINFLSLGSHQTSKSSKHSPINLELTIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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