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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005551`

染色体: Chr02 坐标: 75489952-75493024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005551`
名称	SmilChr02G005551
描述	U-box domain-containing protein 4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75489952 - 75493024 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009513`
GeneID	`131009513`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009513`
原始查询	`LOC131009513`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 4
产物	U-box domain-containing protein 4
Arabidopsis	`AT4G12710` (AT4G12710) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826883] identity=60; qcov=0.914; evalue=5.92e-129; confidence=high
Rice	`Os01g0112500` - identity=49.1; qcov=0.863; evalue=1.77e-83; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009513

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792882.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057792882.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057792882.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792882.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792882.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75490426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr2:75491961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B28,B62,C77,D10
`Chr2:75491972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B120,C80
`Chr2:75492041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:75492065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C51
`Chr2:75492077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:75492087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:75492095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:75492119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B102,C24,C50
`Chr2:75492166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr2:75492182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B50,C14,C42,C43
`Chr2:75492205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C70,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792882.1

394 aa

197

394

Arm

ARM_PUB

PF00514 Arm 121-161 aa PF25598 ARM_PUB 193-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792882.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	121	161	2.5e-18	66.1	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`XP_057792882.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	193	334	1.3e-19	71.5	Plant U-box protein ARM repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936899.1
AGAACATTAAATCACTCAACTAAAAAGATTAAATTGTAATTAATGACGAAAAGTGGGGGACCGATGCGAAAATTATGATCCCTCTTGGAAGTGGAGGAACCGTAGGCAGCCCCACCGCAGACGGAAGTGGTACAACATCTAAAGCGAAACGTCCAAAAACCGCATCTCCGAGCGAGACGTATCATTCCCCAAACATTCCGACAGCTAGAGAGAGAAGCACCCGCCGGCCATGGTTTTAGAGAGAGAGATGGAGGAGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009513
ATGGTTTTAGAGAGAGAGATGGAGGAGGAGGACGACGAGGAGGAGGCAATGCTGAAGAAGGCAGAGGAGGAGAGCGAGAGTAACAGCAGTAGTAACGACGCTTCGTCGTGGAGCCGGAAGATGATGGTGGAGGAGGCGGCGCGGAGGCTCAAGGGCGGAGATCTCAGAGCGAAAATCGAGGCGGCGAGGGATGTGAGGAAGCTTGTCAGGAAGTCGTCCAGCTCCAATTCCAAGTCCGCCGTGCGCTGCCGCTTCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792882.1
MVLEREMEEEDDEEEAMLKKAEEESESNSSSNDASSWSRKMMVEEAARRLKGGDLRAKIEAARDVRKLVRKSSSSNSKSAVRCRFAAAGAIEPLVSMLHGSLPLAAREAALLALLNLAARNQRNKIKIVAAGAVPPLVELLKNRTGNLREVAAAAILSLSSAPSNKPTIAASGAALLLVQILCSGSVQGKVDAVTALYYLSTCEEEPKLALDAKAVPPLIDLLKECKKYSKFAEKTTFLLEIFSASEEGRAAITDVEGGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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