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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005558`

染色体: Chr02 坐标: 75534486-75536323 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005558`
名称	SmilChr02G005558
描述	uncharacterized SmilChr02G005558
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75534486 - 75536323 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009520`
GeneID	`131009520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009520`
原始查询	`LOC131009520`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	period circadian protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819955]; symbol=AT3G07640; hit=AT3G07640; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	period circadian protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819955]; symbol=AT3G07640; hit=AT3G07640; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07640` (AT3G07640) period circadian protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819955] identity=41.3; qcov=1.01; evalue=5.9e-61; confidence=medium
Rice	`Os02g0582400` - identity=34.3; qcov=1.01; evalue=4.62e-40; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25428 (DUF7894)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792897.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792897.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057792897.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057792897.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75534692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B47,C56,C65
`Chr2:75534700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75534734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B6
`Chr2:75534743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75534785`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75534785`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75534795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:75535169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:75535177`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75535177`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75535260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B105,B12,B7,B94
`Chr2:75535270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B50,C14,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792897.1

239 aa

120

239

DUF7894

PF25428 DUF7894 1-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792897.1`	Pfam	`PF25428`	DUF7894	Domain	1	239	4.1e-98	328.2	Domain of unknown function (DUF7894)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936914.1
AGTAAAAAAATTAAATAAATTAGTCATTGGAAAATGAAGGTAGCCGAGAAAGTGATACTCCTACTCGACGGCGGCGTCGCAGCCGCCATAGCCGGCAGTCTCCACCCGAACCCCAACGCTAAGTTTCAGACTGTAAAGGAATCCTTTCGGTTTTCGTTGGAATGCTACGGAATCAAAGATCTGATGGCGTCTGGGGAAGTAATTCATTTTGTCGATTCCGGTGGCCGTTATGAGGTGTCTATTTTGCTGTTGGAGAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009520
ATGAAGGTAGCCGAGAAAGTGATACTCCTACTCGACGGCGGCGTCGCAGCCGCCATAGCCGGCAGTCTCCACCCGAACCCCAACGCTAAGTTTCAGACTGTAAAGGAATCCTTTCGGTTTTCGTTGGAATGCTACGGAATCAAAGATCTGATGGCGTCTGGGGAAGTAATTCATTTTGTCGATTCCGGTGGCCGTTATGAGGTGTCTATTTTGCTGTTGGAGAATCACGAGCCTCCAATCTTAGCTTGTGCTCTGAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792897.1
MKVAEKVILLLDGGVAAAIAGSLHPNPNAKFQTVKESFRFSLECYGIKDLMASGEVIHFVDSGGRYEVSILLLENHEPPILACALNEVLLKLTGDDHSTVPTLIVPFVVPESKLKQENRYSGKSDTVSLYGMKLGPKTDLSELLSSRLQQSPPFSQILHEELALLLHLVNVKKLPTVVMIGVTGHSTSSKNSKEELEVTCQIGEHLASVSSLTFSKEKMVQSPTKTSRDGQEAWRALYG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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