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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005578`

染色体: Chr02 坐标: 75626038-75626772 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005578`
名称	SmilChr02G005578
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75626038 - 75626772 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009541`
GeneID	`131009541`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009541`
原始查询	`LOC131009541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 12-like
Arabidopsis	`AT5G35740` (AT5G35740) Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833551] identity=57.4; qcov=0.849; evalue=3.7e-41; confidence=medium
Rice	`Os07g0510200` (P0409B11.21-2) - identity=46.5; qcov=0.849; evalue=8.39e-29; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009541

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057792928.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057792928.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057792927.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792927.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792927.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75626269`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A22,A7,B40,B50,C25
`Chr2:75626269`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A22,A7,B40,B50,C25
`Chr2:75626383`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C46
`Chr2:75626383`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C46
`Chr2:75626411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:75626505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B61
`Chr2:75626691`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B42,B43,B87,B9,C5
`Chr2:75626691`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B42,B43,B87,B9,C5
`Chr2:75626700`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B42,B43,B87,B9,C5
`Chr2:75626700`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B42,B43,B87,B9,C5
`Chr2:75626715`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A14,B106,B30,B41,B42,B43,B47,B62,B83,B86,B87,B9,C14,C21,C5,C59,C63,C67,C74,C76,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792927.1

137 aa

137

PF07983 X8 31-101 aa

XP_057792928.1

119 aa

119

PF07983 X8 31-101 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792927.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	31	101	1.6e-21	77.4	X8 domain
`XP_057792928.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	31	101	1e-21	78.1	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936945.1
AAGAATAGTCTCTCACTCTTCTGCCTAGTGAGTAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGTCAGCAATCAAGAATAGTCTCACTCTTCTTGCTCTCTTGCTTGTCATGAAGTATTTACAAAAATCAGGTGCAGGAGCGGTGGGGGAGTGGTGCGTGGCAGACGAGCAGAGCTCAGAGAGTGAACTGCAAGCGGCGATGGATTGGGCTTGTGGAATTGGGAATGCCAACTGCAGCAAGATTCAAGTGGGCCAGGCCTGCTTTC...

XM_057936944.1
CTCACTCTTCTGCCTAGTGAGTAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGTCAGCAATCAAGAATAGTCTCACTCTTCTTGCTCTCTTGCTTGTCATGAAGTATTTACAAAAATCAGGTGCAGGAGCGGTGGGGGAGTGGTGCGTGGCAGACGAGCAGAGCTCAGAGAGTGAACTGCAAGCGGCGATGGATTGGGCTTGTGGAATTGGGAATGCCAACTGCAGCAAGATTCAAGTGGGCCAGGCCTGCTTTCGGCCCAATACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009541
ATGTCAGCAATCAAGAATAGTCTCACTCTTCTTGCTCTCTTGCTTGTCATGAAGTATTTACAAAAATCAGGTGCAGGAGCGGTGGGGGAGTGGTGCGTGGCAGACGAGCAGAGCTCAGAGAGTGAACTGCAAGCGGCGATGGATTGGGCTTGTGGAATTGGGAATGCCAACTGCAGCAAGATTCAAGTGGGCCAGGCCTGCTTTCGGCCCAATACCGTTAGGGCCCACGCTTCTTATGCCTTCAACAATTACTACCAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792927.1
MSAIKNSLTLLALLLVMKYLQKSGAGAVGEWCVADEQSSESELQAAMDWACGIGNANCSKIQVGQACFRPNTVRAHASYAFNNYYQKFKRRGGTCYFRGAAYTTALDPSEYLLFYPHTHYYVIYSSRDNIMRHKFIT

XP_057792928.1
MSAIKNSLTLLALLLVMKYLQKSGAGAVGEWCVADEQSSESELQAAMDWACGIGNANCSKIQVGQACFRPNTVRAHASYAFNNYYQKFKRRGGTCYFRGAAYTTALDPSYNSCNYELTP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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