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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005580`

染色体: Chr02 坐标: 75632691-75636781 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005580`
名称	SmilChr02G005580
描述	cyclin-H1-1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75632691 - 75636781 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009546`
GeneID	`131009546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009546`
原始查询	`LOC131009546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-H1-1
产物	cyclin-H1-1
Arabidopsis	`AT5G27620` (CYCH;1) cyclin H;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832824] identity=58.4; qcov=0.985; evalue=2.83e-133; confidence=high
Rice	`Os03g0737600` (Os) - identity=59.2; qcov=0.945; evalue=1.73e-133; confidence=high
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0070985 (transcription factor TFIIK complex)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF00382 (TFIIB); PF16899 (Cyclin_C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792936.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057792936.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792936.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792936.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75634214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:75634741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:75635541`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A16,A20,A23,A25,A5,B102,B105,B138,B16,B17,B20,B27,B28,B34,B44,B48,B54,B66,B70,B75,B89,B98,C18,C19,C2,C26,C27,C30,C35,C39,C4,C44,C60,C61,C64,C75,C76,C78,C79,D11,D2,D8
`Chr2:75635544`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	42	A20,A23,A25,A5,B102,B105,B138,B16,B17,B20,B27,B28,B34,B44,B48,B51,B54,B66,B70,B75,B89,B98,C18,C19,C2,C26,C27,C30,C35,C39,C4,C44,C60,C61,C64,C75,C76,C78,C79,D11,D2,D8
`Chr2:75635875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B61,C41
`Chr2:75635896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B62,C41
`Chr2:75635907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B62,C41,D7
`Chr2:75635915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B62,D7
`Chr2:75636021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:75636394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B65,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792936.1

327 aa

164

327

Cyclin_N

TFIIB

Cyclin_C_2

PF00134 Cyclin_N 70-174 aa PF00382 TFIIB 88-148 aa PF16899 Cyclin_C_2 179-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792936.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	70	174	2.4e-12	47.4	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057792936.1`	Pfam	`PF00382`	TFIIB	Domain	88	148	3.2e-08	34.2	Transcription factor TFIIB repeat
`XP_057792936.1`	Pfam	`PF16899`	Cyclin_C_2	Domain	179	277	2.1e-14	54.4	Cyclin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936953.1
TTTACTCAGCGGAAGTCCCCACTCATAACCTCCGGCCTCCAGATTCCTCGGCGGCGAAGGCGGCGGCGGAGTTTGAAGCGGAATCATCAGTAGTCGGAGTTTCTGGCATTGCTGAAACGTGAAGTTTGAAGTAGCTGGTGAAATTGAAGCACTGAATTTTAGTACAATTTTTCGTAGTTATTGGTGACGGAGATCAATGGCGGATTTTACGACTTCGACACACAGAGCGAAGTGGATATTCACGCCTCAGGCTCTCAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009546
ATGGCGGATTTTACGACTTCGACACACAGAGCGAAGTGGATATTCACGCCTCAGGCTCTCAAGGAGAAATACAAGGAGGCTAATAAACGAGCTAAGCAAGCACTTGAGAAGTATGGAGCTACACGGATGGAAGTAGATGTTGATGGATCCTTCTCTTATGCTGAGCCACAAACTGATGCAAAGGCTAGTGCTGACAAGCATTCACGTCCGAAAGCTCTCAAGACAGAAGAAGAACAACTAATGCGGGCTTTCTACGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792936.1
MADFTTSTHRAKWIFTPQALKEKYKEANKRAKQALEKYGATRMEVDVDGSFSYAEPQTDAKASADKHSRPKALKTEEEQLMRAFYEFKIQDVCDAFKFPRKIQATALIYFKRFYLQWSVMEHHPKNIMLTCIYAACKAEENHVSAEELGKGIEQDHHMILDNEMLVLQSLGFDLIVYSPYRPLEGFITDMQDFGDAKERQPEIMKNFHESAKAEVDKIMRTEAPLLFPPWQLALAALRRSCELHKAIDFERYLKNVHSRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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