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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005586`

染色体: Chr02 坐标: 75664446-75667481 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005586`
名称	SmilChr02G005586
描述	uncharacterized SmilChr02G005586
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75664446 - 75667481 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009551`
GeneID	`131009551`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009551`
原始查询	`LOC131009551`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0514600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os12g0514600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G07760` (AT3G07760) Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819967] identity=88; qcov=0.992; evalue=2.2e-78; confidence=high
Rice	`Os12g0514600` - identity=90.8; qcov=0.952; evalue=1.94e-81; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00536 (SAM_1); PF07647 (SAM_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009551

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792940.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792940.1`
3	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057792940.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792940.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75665346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792940.1

126 aa

126

SAM_1

SAM_2

PF00536 SAM_1 15-52 aa PF07647 SAM_2 16-52 aa

XP_057792941.1

126 aa

126

SAM_1

SAM_2

PF00536 SAM_1 15-52 aa PF07647 SAM_2 16-52 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792940.1`	Pfam	`PF00536`	SAM_1	Domain	15	52	1.8e-07	32.1	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057792940.1`	Pfam	`PF07647`	SAM_2	Domain	16	52	3.8e-08	34.1	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057792941.1`	Pfam	`PF00536`	SAM_1	Domain	15	52	1.8e-07	32.1	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057792941.1`	Pfam	`PF07647`	SAM_2	Domain	16	52	3.8e-08	34.1	SAM domain (Sterile alpha motif)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936957.1
ACCATCGGGAAACATATTTTTAATTTTTCAAGAATTGGAATATTATGTTTTCTCTTCTTTTTTTTAAATAAAGAAAAAGATTTGGAAGATTAAATTTTCGGACGAGTCAAGCGGCAAAATTGGGGCAGATTTGATTTGATTTGACAAGAACAAAAACAAAAGCTAGTAGCTTAGTTTAGTTTAGTTTTTGTAGGCCAAAACCCAACTCCTAAAAAAGTTAGTGAAGTGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTC...

XM_057936958.1
AAGCGGCAAAATTGGGGCAGATTTGATTTGATTTGACAAGAACAAAAACAAAAGCTAGTAGCTTAGTTTAGTTTAGTTTTTGTAGGCCAAAACCCAACTCCTAAAAAAGTTAGTGAAGTGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCCACTCACATTCACTGAGAAAGACCAACGCACTCATCAACAAATGTAGAAAATCAGAACCCTTAATTGCCCCATAAATTCAAAGGTTTGGATTTTGCGCTTTGCAATTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009551
ATGAGCAAAGAGAAAGAGAAGCCGGAGCCTCTGGATTTCTTTATTTGGACTGTTGAGGATGTTGGCCTGTGGTTGGAAGAAATAAATCTTGGTAACTATCGCGAAATATTCAAAGAAAATGGTGTCAATGGAGAGTATTTGGAAGGGATGTCAATGTTTACAACTGAACAGATCCTCCGGTTCATACGAAAGTGCCACATGAAATGGGGGGATTTTATAACATTGTGCAAGGAGCTGAGGCGAATAAAAGTGGCCTGCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792940.1
MSKEKEKPEPLDFFIWTVEDVGLWLEEINLGNYREIFKENGVNGEYLEGMSMFTTEQILRFIRKCHMKWGDFITLCKELRRIKVACLKGEQKVRRPWWAPACLSVVFVKAAKRNRQSRVVSLKLEP

XP_057792941.1
MSKEKEKPEPLDFFIWTVEDVGLWLEEINLGNYREIFKENGVNGEYLEGMSMFTTEQILRFIRKCHMKWGDFITLCKELRRIKVACLKGEQKVRRPWWAPACLSVVFVKAAKRNRQSRVVSLKLEP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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