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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005589`

染色体: Chr02 坐标: 75679580-75682317 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005589`
名称	SmilChr02G005589
描述	scarecrow-like protein 21
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75679580 - 75682317 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009554`
GeneID	`131009554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009554`
原始查询	`LOC131009554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 21
产物	scarecrow-like protein 21
Arabidopsis	`AT5G48150` (PAT1) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834867] identity=63.3; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0583600` (CIGR2) - identity=58.6; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792944.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792944.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792944.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792944.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75680771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B45
`Chr2:75680898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:75680991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B40,B64
`Chr2:75681032`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B17
`Chr2:75681032`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B17
`Chr2:75681112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:75681171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B59
`Chr2:75681175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C78,D2
`Chr2:75681178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:75681180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C2
`Chr2:75681186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C31,C47,C9
`Chr2:75681207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792944.1

520 aa

260

520

GRAS

PF03514 GRAS 150-520 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792944.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	150	520	3.3e-137	458.1	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936961.1
GCAAATTTCCACCCTCTTATTTCCTTTCACAGGCAGAAACCTCTCTCTCTAATCAGCCATTTCTCTCTCTAGAAAAAGAACTACTTTTTCTTGGGGATGTAACTGCATTGGACAAAAAAAGCACAAACTTGGGATTCTCCAAAGTTACAATTTTTAAAGTTTGTTTTGCTGGATTTTGTATTGAAAATCGTAGTGTAAGATACAAAAATGTCGAATACATGGTATTGCCAGCCTCTGAGGAAGCTAGAGGCTTACTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009554
ATGTCGAATACATGGTATTGCCAGCCTCTGAGGAAGCTAGAGGCTTACTCCCTTCAACAATGTCAGCCATTAAACCACCAACAGCTATGGAGTTACAACAACATCAGCAACGGCAATGGGTGCTCGATTCTCGTCTCTCAGGACCGGTTTTGCACGCTGGAATCGTCCACGCTGACCTCAGCTTCAACGGTCAGTCTGTCGCCCAATGAGAGCTCGTTGTCTCAGCAAGAGTCTCAGTCGTACCCTGCGGGTCTGCTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792944.1
MSNTWYCQPLRKLEAYSLQQCQPLNHQQLWSYNNISNGNGCSILVSQDRFCTLESSTLTSASTVSLSPNESSLSQQESQSYPAGLLQVNEGCAAEEEDVDELKHKLKELETVMFGPDVDILDDSGVSTRLASAEIDSWRQLMEVIPRGDLKQLLAACAKAVSNCDWLMAQWLMSELRQLVSVSGAPVQRLGAYMLEGLVALLSASGSSIGKSLKLREPASFELLSYMHMLYEVCPYFKFGYMSANGAIAEAMKDENRVHI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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