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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005595`

染色体: Chr02 坐标: 75694468-75702008 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005595`
名称	SmilChr02G005595
描述	golgin candidate 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75694468 - 75702008 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009558`
GeneID	`131009558`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009558`
原始查询	`LOC131009558`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	golgin candidate 1-like
产物	golgin candidate 1-like
Arabidopsis	`AT2G19950` (GC1) golgin Putative 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816514] identity=58.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0744400` - identity=54.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0000301 (retrograde transport, vesicle recycling within Golgi); GO:0007030 (Golgi organization); GO:0031985 (Golgi cisterna)
KEGG	-
Pfam	PF09787 (Golgin_A5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009558

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057792947.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057792947.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792947.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792947.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75694834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B76,B95
`Chr2:75695631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C49
`Chr2:75696508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:75696535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:75697903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:75697912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:75697939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:75697940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr2:75698772`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	62	A10,A21,A3,A6,A7,B10,B101,B105,B107,B109,B110,B113,B115,B124,B127,B128,B130,B135,B139,B140,B16,B17,B29,B4,B45,B47,B48,B49,B50,B54,B65,B72,B74,B84,B85,B93,B99,C13,C15,C18,C19,C26,C34,C35,C36,C4,C51,C55,C63,C64,C66,C67,C70,C73,C74,C75,C80,C81,C83,C87,D10,D11
`Chr2:75698774`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	62	A10,A21,A3,A6,A7,B10,B101,B105,B107,B109,B110,B113,B115,B124,B127,B128,B130,B135,B139,B140,B16,B17,B29,B4,B45,B47,B48,B49,B50,B54,B65,B72,B74,B84,B85,B93,B99,C13,C15,C18,C19,C26,C34,C35,C36,C4,C51,C55,C63,C64,C66,C67,C70,C73,C74,C75,C80,C81,C83,C87,D10,D11
`Chr2:75698907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:75698920`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792947.1

707 aa

354

707

Golgin_A5

PF09787 Golgin_A5 444-680 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792947.1`	Pfam	`PF09787`	Golgin_A5	Coiled-coil	444	680	4e-20	73.3	Golgin subfamily A member 5

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936964.1
GAAGATCAAATTGAAAAATTGGTTGGATCTTTGGTTCAATATCGACTATTTAGATCGGCTAACTGAAAACCGAACTTTATTTTTCCTACTACTCGAAATCTTTTTTTTTTTTTGGGCTGTGTGTGTATGTGTTGGCTGCAGGTGTTCTTCCTAAACACACCTTTGAATTGCATCTGGGAATAAAATCAAATTAAAATACAGCTTCTCCCTCTCTATCTCGCAACAAAAAGGGCGAAATACAATGCAGATGAGAAATCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009558
ATGGCTTCGTGGCTGAAGGCGGCTGAAGATTTATTTGAAGTAGTGGACCGAAAGGCGAAGCTAGCAGTTGGGGAGAAGCCAGATGAACTTCCTGTTCCCACCAAAGGTTCTAATGGGCGAGGATCTCAAGCCAAGAGGGCTAGAGCAAGAGCAAAGAAGAAACTCTTATCCAATGAAGCTCCTTCTGCTGTTGATAATGAAAAAGAGCAAACTATACCTGAAACATCACAATCACCAGCACAACTTGATGGAAACATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792947.1
MASWLKAAEDLFEVVDRKAKLAVGEKPDELPVPTKGSNGRGSQAKRARARAKKKLLSNEAPSAVDNEKEQTIPETSQSPAQLDGNIPSALIENSETNPGVPTNRVDSDEQYKADNDGSITETSVLGTISNNEVTPGGGHVDTEKSTDVEATASNMNGESRMEEFGDNPVGNPSNAPIDAHVVNGDPSSDLNQNLISEDAGTLKNIELSGSQTLHEETPIKADTQSKDVDLINETDVKNKEHQEQETVKSAVKVQEQLEEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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