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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003220`

染色体: Chr01 坐标: 50971465-50972430 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003220`
名称	SmilChr01G003220
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 7.2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50971465 - 50972430 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009573`
GeneID	`131009573`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009573`
原始查询	`LOC131009573`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 7.2-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 7.2-like
Arabidopsis	`AT1G72130` (AT1G72130) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843544] identity=25.8; qcov=0.81; evalue=4.43e-19; confidence=low
Rice	`Os02g0716800` (OsNRT1.5B) - identity=27.2; qcov=0.745; evalue=1.31e-22; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009573

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057792973.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057792973.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057792973.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792973.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792973.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50971524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:50971673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr1:50971723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:50971871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D8
`Chr1:50971953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B124,C40,C65
`Chr1:50971968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B5,B85,C6,C8
`Chr1:50972016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B3,C77
`Chr1:50972196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C21
`Chr1:50972415`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	B109,B12,B128,B135,B15,B16,B26,B32,B5,B75,B78,B85,B9,C14,C33,C34,C37,C6,C79,C8,C82,D4,D7
`Chr1:50972417`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B135,B16,B26,B75,C8
`Chr1:50972417`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B135,B16,B26,B75,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792973.1

321 aa

160

321

PTR2

PF00854 PTR2 19-204 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792973.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	19	204	3.3e-07	30.3	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936990.1
ATGCCAAAAACAAAATTCAGGTGGTTAGACAGAGCGGCGGAGGCAGGCAATGGGAGTAGCGTTGAACAAGTTATGAGAGTTAAGCTTGTGTTGAAGATGCTTCCGTTGTGGTCTTGTTTCCTCACTCTAAGCCTGGTTTATGCTTCCGGAACCACCTTCTTCTTCGAAGAAGCCAGCAGCCTTCTTAACGACAATAATTATCTAATTCCCATTCTCTTTCTCCACAATCTGATGAGATTTACAGAGTTTGCGGTCTCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009573
ATGCCAAAAACAAAATTCAGGTGGTTAGACAGAGCGGCGGAGGCAGGCAATGGGAGTAGCGTTGAACAAGTTATGAGAGTTAAGCTTGTGTTGAAGATGCTTCCGTTGTGGTCTTGTTTCCTCACTCTAAGCCTGGTTTATGCTTCCGGAACCACCTTCTTCTTCGAAGAAGCCAGCAGCCTTCTTAACGACAATAATTATCTAATTCCCATTCTCTTTCTCCACAATCTGATGAGATTTACAGAGTTTGCGGTCTCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792973.1
MPKTKFRWLDRAAEAGNGSSVEQVMRVKLVLKMLPLWSCFLTLSLVYASGTTFFFEEASSLLNDNNYLIPILFLHNLMRFTEFAVSETSSYVIRKLEEKKQYNQQKMELVRIGIGMSCCVPCCVTAWATATRRQHGTISVYWLTPQYFLLGLMGGLSQDGLASFYESQVSESLSSFGPPFAEFVMGFGKFMSILCILIFSRSPFKWFQSDIDSSSLNKYYTLLAVLSFVNAVIYCLVACWYKDHTFLLKDEENGSLAQQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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