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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002566`

染色体: Chr02 坐标: 44648304-44652124 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002566`
名称	SmilChr02G002566
描述	uncharacterized SmilChr02G002566
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	44648304 - 44652124 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009576`
GeneID	`131009576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009576`
原始查询	`LOC131009576`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=28.2; qcov=0.346; evalue=2.4e-38; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=26.3; qcov=0.651; evalue=8.77e-76; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792975.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057792975.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792975.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792975.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:44648331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr2:44648341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B4,B99,C36,C46
`Chr2:44648366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr2:44648438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr2:44648439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C13,C17
`Chr2:44648447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:44648471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C40
`Chr2:44648509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B4,B57,C36,C46
`Chr2:44648564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,D11
`Chr2:44648648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr2:44648655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B126,B88,C22,C6
`Chr2:44648657`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792975.1

1250 aa

625

1250

RVT_1

zf-RVT

RVT_3

PF00078 RVT_1 372-631 aa PF13966 zf-RVT 896-969 aa PF13456 RVT_3 1099-1219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792975.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	372	631	5.2e-30	105.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057792975.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	896	969	4.7e-16	59.9	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057792975.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	1099	1219	1.5e-17	64.4	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936992.1
ATGTGCTCTAACATCTGGTTTCTAGCTCACCCGTCTGTGGTTACAAATGTGGTCTGGTCGTCGAATCAAACGGTTATTGTTGATTGCGTTTGGAATGCCTCTTCTTTCCGTATTGCGGTTGTTCATGGTTCTAATTGTCTGATTGAACGTCGGCAACTTTGGATTGACCTTCTTCATCATTCTGATGGAGCTACCTTGTTCATGGGGGATTTTAATGCTGTAAAAGGGGCGCATGAGCGTTACAGCTTGGTTAGTCCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009576
ATGTGCTCTAACATCTGGTTTCTAGCTCACCCGTCTGTGGTTACAAATGTGGTCTGGTCGTCGAATCAAACGGTTATTGTTGATTGCGTTTGGAATGCCTCTTCTTTCCGTATTGCGGTTGTTCATGGTTCTAATTGTCTGATTGAACGTCGGCAACTTTGGATTGACCTTCTTCATCATTCTGATGGAGCTACCTTGTTCATGGGGGATTTTAATGCTGTAAAAGGGGCGCATGAGCGTTACAGCTTGGTTAGTCCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792975.1
MCSNIWFLAHPSVVTNVVWSSNQTVIVDCVWNASSFRIAVVHGSNCLIERRQLWIDLLHHSDGATLFMGDFNAVKGAHERYSLVSPNRQACREFCEFIQATRFIESPTSGLKFTWSGRRFLPTHVESLLDRTLVSDSFAQNWASINTHALPRITSDHSPLVFQCIGSAVRRGNNFRFLSMWTTHSSFFAMVEHSWGQQMATSCPIFRVMAKLRRLRTALKSWNKEVFGNVDVAIRELGNNLAAVQENISVSGYTDELFNE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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