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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002573`

染色体: Chr02 坐标: 44733032-44734240 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002573`
名称	SmilChr02G002573
描述	uncharacterized SmilChr02G002573
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	44733032 - 44734240 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009582`
GeneID	`131009582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009582`
原始查询	`LOC131009582`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=54.7; qcov=0.264; evalue=5.75e-35; confidence=weak
Rice	`Os01g0872900` - identity=59.9; qcov=0.719; evalue=1.92e-129; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792979.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057792979.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057792979.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792979.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:44733049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B3,C47,C53,C7
`Chr2:44733054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:44733058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:44733114`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A13,A14,A15,A20,A23,A25,A5,B100,B108,B125,B15,B19,B36,B47,B61,B79,C12,C23,C29,C34,C36,C39,C43,C47,C48,C56,C57,C65,C70,D9
`Chr2:44733176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B62,C82
`Chr2:44733253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B118,B41,B61,C51
`Chr2:44733253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B41,B61,C51
`Chr2:44733268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B69
`Chr2:44733268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:44733293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C34
`Chr2:44733310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:44733319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792979.1

402 aa

201

402

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 66-104 aa PF04827 Plant_tran 174-375 aa PF13359 DDE_Tnp_4 203-366 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792979.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	66	104	4.1e-15	56.0	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057792979.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	174	375	1.7e-100	335.5	Plant transposon protein
`XP_057792979.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	203	366	5.5e-07	30.1	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936996.1
ATGGCCCCTAGTTCTAATATTGATGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAAGCATGGGAACAAAGCGTTGCTGAACATAATTGCCAACTTGATCGCATCATTGAGGATGTGGTCATCCATGCCGCAAGTCTATCTGTACAACCTACCAATCATGCCGTTAGAGGAATGAGGCAGTATATTGAAAGAAGACGTGAGATAGGTCATGAAGGTGTGTTCGAGCAGTACTTTTCAGAAGATCAAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009582
ATGGCCCCTAGTTCTAATATTGATGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAAGCATGGGAACAAAGCGTTGCTGAACATAATTGCCAACTTGATCGCATCATTGAGGATGTGGTCATCCATGCCGCAAGTCTATCTGTACAACCTACCAATCATGCCGTTAGAGGAATGAGGCAGTATATTGAAAGAAGACGTGAGATAGGTCATGAAGGTGTGTTCGAGCAGTACTTTTCAGAAGATCAAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792979.1
MAPSSNIDASNSSDDEAWEQSVAEHNCQLDRIIEDVVIHAASLSVQPTNHAVRGMRQYIERRREIGHEGVFEQYFSEDQIYPPEYFRTRFRMRKPLFERIMNKLVATDRFFQQRLDAAGRLGMSPIQKCTAAMRVLAYGTSADLHDEYLRMSAQVIRKSVIKFVEGVISNFGAEYLRKPTEEDMTSLLHIEEQRGFPGMMDNIDCMHWEWKNCPTAWAGQYAGRSGTPTIILEAFASQDLCIWHAFFGTPGSRNDINVLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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