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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002584`

染色体: Chr02 坐标: 44910913-44911431 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002584`
名称	SmilChr02G002584
描述	uncharacterized SmilChr02G002584
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	44910913 - 44911431 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009585`
GeneID	`131009585`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009585`
原始查询	`LOC131009585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=25.8; qcov=0.971; evalue=4.52e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.1; qcov=0.808; evalue=6.66e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009585

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792983.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792983.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057792983.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792983.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792983.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:44910927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,B95,C14
`Chr2:44910930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B12,B138
`Chr2:44910968`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A20,A9,B109,B12,B138,B23,B37,B38,B49,B69,B85,B90,B91,C25,C31,C41,C50,C54,C80,C82,D5
`Chr2:44910991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B29,C37,D11
`Chr2:44910991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,C37,D11
`Chr2:44911013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A1,A3,B109,B123,B130,B138,B139,B25,B34,B44,B45,B56,B60,B96,C32,C45,C49,C5,C68,C71,D3
`Chr2:44911014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A4,B104,B11,B18,B20,B41,B43,B48,B73,B89,C72
`Chr2:44911055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B18,B20,C72
`Chr2:44911059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:44911122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B95,C14
`Chr2:44911144`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	D10,D11
`Chr2:44911144`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792983.1

172 aa

172

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 14-85 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792983.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	14	85	2.4e-15	57.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937000.1
ATGGACACTAGGAACGCGGAGACGCCGACGACCTTTAATAAAGAGATGATCGCGAAGGTTTGGGATACACCTGCTCCTCAGAAAGCAAGAGTGACAGCATGGAGGATCTTGAGGAATAGATTGCCAATATGCGACAACTTGCGGAAGAGGAACATACCGATGGTTGATGAGGAGATTATGTGCAATATGTGTTTCCACCAAATCGAAACGACAAACCATCTGTTTCTTCTATGTCCGAAGACTGGAGTGGTGTGGGACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009585
ATGGACACTAGGAACGCGGAGACGCCGACGACCTTTAATAAAGAGATGATCGCGAAGGTTTGGGATACACCTGCTCCTCAGAAAGCAAGAGTGACAGCATGGAGGATCTTGAGGAATAGATTGCCAATATGCGACAACTTGCGGAAGAGGAACATACCGATGGTTGATGAGGAGATTATGTGCAATATGTGTTTCCACCAAATCGAAACGACAAACCATCTGTTTCTTCTATGTCCGAAGACTGGAGTGGTGTGGGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792983.1
MDTRNAETPTTFNKEMIAKVWDTPAPQKARVTAWRILRNRLPICDNLRKRNIPMVDEEIMCNMCFHQIETTNHLFLLCPKTGVVWDEIQRWLGVSAARPHCAVSHLDFFAHLGRGKKSQKFLTALWICIIWLLWKRRNESRFEGKAWDIKNTIYDWGCESKNVELEQNFQAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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