当前解析结果
SmilChr02G002630| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002630 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002630 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002630 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 45684161 - 45685721 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009602 |
|---|---|
| GeneID | 131009602 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009602 |
| 原始查询 | LOC131009602 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009602 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793000.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057793000.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793000.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793000.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793000.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:45684170 |
T |
TA |
1bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 2 | C20,C72 |
Chr2:45684170 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | C20,C72 |
Chr2:45684193 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 53 | A14,A20,A4,A7,A9,B1,B100,B102,B104,B114,B124,B125,B127,B131,B14,B15,B16,B22,B23,B37,B38,B60,B64,B71,B78,B81,B82,B90,B92,C16,C17,C19,C22,C27,C30,C31,C32,C35,C36,C45,C46,C48,C53,C54,C56,C59,C6,C61,C67,C70,C74,D11,D8 |
Chr2:45684238 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B128,B18,B38,C70 |
Chr2:45684262 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B14,B15,B38,C70 |
Chr2:45684402 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B19 |
Chr2:45684555 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,C51 |
Chr2:45685479 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,B28,C26 |
Chr2:45685579 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B4,B78,B97 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。