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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002670`

染色体: Chr02 坐标: 46281056-46282147 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002670`
名称	SmilChr02G002670
描述	uncharacterized SmilChr02G002670
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46281056 - 46282147 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009613`
GeneID	`131009613`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009613`
原始查询	`LOC131009613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=32.1; qcov=0.54; evalue=7.5e-26; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009613

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793011.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057793011.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793011.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057793011.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057793011.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46281069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr2:46281088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr2:46281107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr2:46281133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B88,C39,C57,D1
`Chr2:46281371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A13,A16,B117,B119,B128,B138,B140,B84,B88,C13,C28,C31,C39,C50,C58,C74,C82,D1
`Chr2:46281389`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C15
`Chr2:46281389`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C15
`Chr2:46281440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B113,C14,C20,C25,C4
`Chr2:46281440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,C14,C20,C25,C4
`Chr2:46281443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A16,B117,B119,C28,C39,D1
`Chr2:46281484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C55
`Chr2:46281497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B34,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793011.1

363 aa

182

363

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

zf-CCHC

PF19259 Ty3_capsid 35-213 aa PF03732 PEG10_N-capsid 44-123 aa PF00098 zf-CCHC 287-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793011.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	35	213	2.8e-08	34.1	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057793011.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	44	123	5.1e-13	49.9	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057793011.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	287	304	2e-05	25.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937028.1
ATGGAAGGTGCACCAAGAGGACGTGGTAGAGGGCGCGAACGTGGCCGTGGGCGCGGTAGGGGATTTGTACCCGAAGAGCCTATTCCACAAGTAGCACCAAATCGCACAGCCGAGGAAAAGTTTCGCAAGGAAAAACCTCCAACGTTTGATGGATTGGGCGAACCTGCGGATGCCGAGAAATGGGTTAGGGCAATAGAACGGATCTTCAACTACATCCGTTGTGATGATGAGGATAAAGTGGCGTGCGCAATTTATCAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009613
ATGGAAGGTGCACCAAGAGGACGTGGTAGAGGGCGCGAACGTGGCCGTGGGCGCGGTAGGGGATTTGTACCCGAAGAGCCTATTCCACAAGTAGCACCAAATCGCACAGCCGAGGAAAAGTTTCGCAAGGAAAAACCTCCAACGTTTGATGGATTGGGCGAACCTGCGGATGCCGAGAAATGGGTTAGGGCAATAGAACGGATCTTCAACTACATCCGTTGTGATGATGAGGATAAAGTGGCGTGCGCAATTTATCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793011.1
MEGAPRGRGRGRERGRGRGRGFVPEEPIPQVAPNRTAEEKFRKEKPPTFDGLGEPADAEKWVRAIERIFNYIRCDDEDKVACAIYQLVDEADFWWESVRRTMTDEQWENFTWEEFKAELYEKYIPGCYRQKKQNEFWNLRQKTGTVTEYDRAFNQLSRYAPTLVDSDEKRAEKFRNGLRHEIAISLASQGGLTYAQTLSRALTIESLLPREKGKSLEQSGFVPSQDGSKGKRKWNEGTGGNIGNGKKPWVANQNQNQHQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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