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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002671`

染色体: Chr02 坐标: 46289738-46291631 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002671`
名称	SmilChr02G002671
描述	uncharacterized SmilChr02G002671
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46289738 - 46291631 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009614`
GeneID	`131009614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009614`
原始查询	`LOC131009614`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G17450` (AT3G17450) hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009] identity=24.7; qcov=0.75; evalue=2.93e-37; confidence=weak
Rice	`Os06g0658400` - identity=49.7; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02892 (zf-BED); PF04937 (DUF659)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793012.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793012.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793012.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793012.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46289854`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A22,B103,B104,B117,B121,B125,B127,B21,B23,B24,B42,B43,B52,B68,B70,C55,C57,C8,D9
`Chr2:46289857`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B45,C10
`Chr2:46289857`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B45,C10
`Chr2:46289893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr2:46290027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:46290078`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A10,A13,A20,A23,A3,A5,B107,B12,B15,B19,B35,B38,B44,B46,B55,B83,B91,B99,C19,C21,C36,C39,C40,C46,C59,C61,C63,C71,C72,C83,D11,D3,D5
`Chr2:46290081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A23,A5,B15,C46
`Chr2:46290096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C6
`Chr2:46290212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A7,C10,C26,C86
`Chr2:46290315`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C86
`Chr2:46290315`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C86
`Chr2:46290317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793012.1

609 aa

304

609

zf-BED

DUF659

PF02892 zf-BED 27-67 aa PF04937 DUF659 204-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793012.1`	Pfam	`PF02892`	zf-BED	Domain	27	67	0.00012	22.8	BED zinc finger
`XP_057793012.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	204	367	5.5e-46	156.6	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937029.1
ATGGATTCTTCAAGTTCTGTTCATGCTGATGGTGATACAAATGAAAATGATAATGAGAAGGAGAGTTCTAGCTGTTGGCCTTTGTGGAAATATGTAGAGAAGCAATCGAAAATTGGTAAAGGGGGTCGAAATACAAAATTTAAATGTATGTATTGCAAAAATGTGTATCCTGGGTCTTACTCAAGATTGAGGAATCATTTGTTGAAAAATTCTGGTATGGGAATTGCCATATGCCATAAAGCTACTGTTGCCAATGTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009614
ATGGATTCTTCAAGTTCTGTTCATGCTGATGGTGATACAAATGAAAATGATAATGAGAAGGAGAGTTCTAGCTGTTGGCCTTTGTGGAAATATGTAGAGAAGCAATCGAAAATTGGTAAAGGGGGTCGAAATACAAAATTTAAATGTATGTATTGCAAAAATGTGTATCCTGGGTCTTACTCAAGATTGAGGAATCATTTGTTGAAAAATTCTGGTATGGGAATTGCCATATGCCATAAAGCTACTGTTGCCAATGTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793012.1
MDSSSSVHADGDTNENDNEKESSSCWPLWKYVEKQSKIGKGGRNTKFKCMYCKNVYPGSYSRLRNHLLKNSGMGIAICHKATVANVLEMSKMEEQASSKRDAVKIKDIPLPRSVCDSVGSFSVTMTEVEPSSFKLEGYDPLKKRKIVDGPLGKAFNAQAREILDGEIARMFYSAGLPFNLAKNPHFIKSYSLAANSNVAGYNPPGYNALRTKLLKNERAHLQTLLEATKSTWKSKGVTIVCDGWTDPQRRPLINFMAINE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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