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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002711`

染色体: Chr02 坐标: 46963126-46965683 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002711`
名称	SmilChr02G002711
描述	rhodanese-like domain-containing protein 4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46963126 - 46965683 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009622`
GeneID	`131009622`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009622`
原始查询	`LOC131009622`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhodanese-like domain-containing protein 4, chloroplastic
产物	rhodanese-like domain-containing protein 4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G01050` (TROL) thylakoid rhodanese-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827921] identity=61.4; qcov=0.515; evalue=2.02e-58; confidence=medium
Rice	`Os02g0257300` (OsStr12) - identity=46.2; qcov=0.578; evalue=1.56e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28616 (STR4_N); PF30980 (STR4_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009622

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793019.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057793019.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057793019.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793019.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793019.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46964193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B103,B23,B71,C14
`Chr2:46964356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B99,C31,C43
`Chr2:46965367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,C67
`Chr2:46965394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C55,C67
`Chr2:46965623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B92,B93,C68
`Chr2:46965625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B92,B93,C68
`Chr2:46965664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B132,B33,B38,B78,B92,B93,C32,C51,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793019.1

367 aa

184

367

STR4_M

STR4_N

PF30980 STR4_M 153-200 aa PF28616 STR4_N 248-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793019.1`	Pfam	`PF30980`	STR4_M	Domain	153	200	2.6e-24	86.1	STR4 middle domain
`XP_057793019.1`	Pfam	`PF28616`	STR4_N	Domain	248	274	7.7e-14	51.8	STR4 N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937036.1
ATTCGCCGTCGTGTTAGCTGGTTCGGAAGGTTTTGTGGCCGGAATTGTGGTCTGATTCGGCTTCAAGACTTCAACTTTATCTTGAATTTGAGTCTGATTTTGCTTCGATATTTGTCGCCAGAAGTCACCAACCGTTGGGAAACCTCCTGGGCTGTTCAGAACTCGAGAATTAGGTGCTCCGTCACTTCCAATGAAGTTGAAGCGCCGGCGGTGGTGAAGTTAGGGGAACTGAAGAAGAAAGCTGAGCGCTATGGGGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009622
ATTCGCCGTCGTGTTAGCTGGTTCGGAAGGTTTTGTGGCCGGAATTGTGGTCTGATTCGGCTTCAAGACTTCAACTTTATCTTGAATTTGAGTCTGATTTTGCTTCGATATTTGTCGCCAGAAGTCACCAACCGTTGGGAAACCTCCTGGGCTGTTCAGAACTCGAGAATTAGGTGCTCCGTCACTTCCAATGAAGTTGAAGCGCCGGCGGTGGTGAAGTTAGGGGAACTGAAGAAGAAAGCTGAGCGCTATGGGGTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793019.1
IRRRVSWFGRFCGRNCGLIRLQDFNFILNLSLILLRYLSPEVTNRWETSWAVQNSRIRCSVTSNEVEAPAVVKLGELKKKAERYGVFFLTYDLKDEEETKSWKKLVNIAVSGAAGMISNHLLFKLASGEVLGPDKPIALKLLGSERSLQALEARFDGNSELVAELVTVNGFKAAYAIKDGAEGPRGWKNNDLPWIAPKKTVGIDLSGLTDSFEDVSEAVPLALGVAAAAGLGLLTFTEVDIILQVLGSAALVQFVSKKLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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