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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003240`

染色体: Chr01 坐标: 51140295-51140618 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003240`
名称	SmilChr01G003240
描述	uncharacterized SmilChr01G003240
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51140295 - 51140618 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009625`
GeneID	`131009625`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009625`
原始查询	`LOC131009625`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF3511 domain protein (DUF3511) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816465]; symbol=AT2G19460; hit=AT2G19460; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF3511 domain protein (DUF3511) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816465]; symbol=AT2G19460; hit=AT2G19460; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G19460` (AT2G19460) DUF3511 domain protein (DUF3511) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816465] identity=52.9; qcov=0.794; evalue=6.19e-21; confidence=medium
Rice	`Os03g0302500` - identity=55.1; qcov=0.458; evalue=1.15e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12023 (DUF3511)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009625

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793024.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057793024.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793024.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793024.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793024.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51140354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B24,C58,C75
`Chr1:51140475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793024.1

107 aa

107

DUF3511

PF12023 DUF3511 62-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793024.1`	Pfam	`PF12023`	DUF3511	Family	62	105	1.1e-25	89.9	Domain of unknown function (DUF3511)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937041.1
ATGGAGAAATATTCAAGATCCAATTCCAGCAGAGAGGGTGTGGTGCAGCCAAGCAGCATGAATGGCCTGAGGAGTTACAGTGTCTCAGTAACTCAAGCTCCAAGGTTTGATCACCTCAACAATAATTTGAAGAAAAGCAAAACCACCAAAATTAATGATACAAAGAATTGGAATTTTGGTGTGGATCATCCTGAGCTGCAGAGGAAGAAGAGAGTTGCTTGCTACAAAGCTTACACAGTGGAGGGGAAGATGAAGGGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009625
ATGGAGAAATATTCAAGATCCAATTCCAGCAGAGAGGGTGTGGTGCAGCCAAGCAGCATGAATGGCCTGAGGAGTTACAGTGTCTCAGTAACTCAAGCTCCAAGGTTTGATCACCTCAACAATAATTTGAAGAAAAGCAAAACCACCAAAATTAATGATACAAAGAATTGGAATTTTGGTGTGGATCATCCTGAGCTGCAGAGGAAGAAGAGAGTTGCTTGCTACAAAGCTTACACAGTGGAGGGGAAGATGAAGGGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793024.1
MEKYSRSNSSREGVVQPSSMNGLRSYSVSVTQAPRFDHLNNNLKKSKTTKINDTKNWNFGVDHPELQRKKRVACYKAYTVEGKMKGSVRKSFRWIKDTCNQFVHGIW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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