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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002820`

染色体: Chr02 坐标: 48291014-48291739 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002820`
名称	SmilChr02G002820
描述	uncharacterized SmilChr02G002820
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48291014 - 48291739 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009642`
GeneID	`131009642`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009642`
原始查询	`LOC131009642`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=27.4; qcov=0.56; evalue=5.53e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.2; qcov=0.793; evalue=1.4e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009642

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793038.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793038.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057793038.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793038.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48291020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:48291031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B69,C31,C41,C77,C82
`Chr2:48291032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C7
`Chr2:48291034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C28
`Chr2:48291037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B55
`Chr2:48291047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B104,B106,B139,B55,C20,C28
`Chr2:48291051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B106,C41,C9
`Chr2:48291071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,D5
`Chr2:48291073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:48291095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	78	A11,A18,A21,A3,A6,A8,B10,B104,B109,B112,B113,B120,B122,B125,B127,B129,B130,B131,B135,B138,B14,B15,B22,B24,B28,B30,B31,B35,B36,B37,B38,B39,B47,B56,B66,B69,B70,B72,B73,B75,B78,B82,B88,B9,B92,B94,B96,B97,C1,C17,C21,C22,C23,C26,C29,C3,C30,C32,C36,C38,C39,C44,C46,C47,C50,C54,C56,C6,C61,C68,C79,C8,C84,C87,C9,D1,D11,D4
`Chr2:48291096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A13,A8,B106,B13,B44,B54,B81,B90,B92,B94,B97,C24,C54,C67
`Chr2:48291099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C15,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793038.1

241 aa

120

241

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 43-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793038.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	43	137	4.5e-15	56.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937055.1
ATGGAGGAGAGAGTTATTCGACTGGGAGCGGGGGCGACTAACTCTTTACTTTCGGTCATTTCTGATGTTTGTCCAAGTGCAGGAATTGATGATCAGTGGATTTGGTGTGGAACTAAAGATGGCAGTTTCTCCACAAAAACTGCTTACATGGCGATCAAGGCTTCAAGGAATGCAACTGCTCCAGCGGTCATCAACGAGAAGGAGTTGGCTATGGTGTGGGACACACCAGCTATTCACAAAGCTCGAGTGAACGCGTGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009642
ATGGAGGAGAGAGTTATTCGACTGGGAGCGGGGGCGACTAACTCTTTACTTTCGGTCATTTCTGATGTTTGTCCAAGTGCAGGAATTGATGATCAGTGGATTTGGTGTGGAACTAAAGATGGCAGTTTCTCCACAAAAACTGCTTACATGGCGATCAAGGCTTCAAGGAATGCAACTGCTCCAGCGGTCATCAACGAGAAGGAGTTGGCTATGGTGTGGGACACACCAGCTATTCACAAAGCTCGAGTGAACGCGTGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793038.1
MEERVIRLGAGATNSLLSVISDVCPSAGIDDQWIWCGTKDGSFSTKTAYMAIKASRNATAPAVINEKELAMVWDTPAIHKARVNAWRILKNRMPTCDNLGKRSVPLTTEEMTCNACFHSPESANHTFLSCPKSERVWDEVQRWMGITSARPRLIASHFVTFIHMGRGKRIEKLLKAIWMCTNWILWKRRNESRFEGRPWTIDSVISEIKARIWSWNYEFCIVEKGLSFSSWSSNDLLLKLM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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