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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002877`

染色体: Chr02 坐标: 49038688-49045424 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002877`
名称	SmilChr02G002877
描述	uncharacterized SmilChr02G002877
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49038688 - 49045424 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009651`
GeneID	`131009651`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009651`
原始查询	`LOC131009651`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=27.3; qcov=0.669; evalue=3.62e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.5; qcov=0.611; evalue=4.6e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009651

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793045.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057793045.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793045.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793045.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793045.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49038703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:49038725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B29,B97
`Chr2:49038750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B32,B60
`Chr2:49038754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A2,A3,A7,B100,B32,B41,B60,C1,C3,C36,C62,C70,C71,C72
`Chr2:49038760`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr2:49038760`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr2:49038770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C81
`Chr2:49038776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B108
`Chr2:49038778`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B95,D9
`Chr2:49038778`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B95,D9
`Chr2:49038780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B2,C49
`Chr2:49038783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793045.1

296 aa

148

296

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 114-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793045.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	114	190	4.7e-14	53.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937062.1
ATGACGGTGGATTTCGGGAACGGCGGTGGTGGCTCTGCCATCGCCGATAAATCAGAGAGGGTGGCGCGATTTTCGGGGCTAGGGATTTCAGACGACTGGTTTGAGGGTGGTGGTTGTTGGCTACGGTGGTGGTGGTTGTTTTCATATTTGAGGGTGGTGCTCTTGAATCTGAGGGTGGTCGGTGGTGGTGGTGCTCCGGTCGCCGGCGGCAGTGAGTTGCTGGCAAATTTGTGGTTGGAGTTCGATCACAATCGACCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009651
ATGACGGTGGATTTCGGGAACGGCGGTGGTGGCTCTGCCATCGCCGATAAATCAGAGAGGGTGGCGCGATTTTCGGGGCTAGGGATTTCAGACGACTGGTTTGAGGGTGGTGGTTGTTGGCTACGGTGGTGGTGGTTGTTTTCATATTTGAGGGTGGTGCTCTTGAATCTGAGGGTGGTCGGTGGTGGTGGTGCTCCGGTCGCCGGCGGCAGTGAGTTGCTGGCAAATTTGTGGTTGGAGTTCGATCACAATCGACCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793045.1
MTVDFGNGGGGSAIADKSERVARFSGLGISDDWFEGGGCWLRWWWLFSYLRVVLLNLRVVGGGGAPVAGGSELLANLWLEFDHNRPDSRIWVTSKDGMFHPRDLYFAIANTSTSEEQATDHWPSLWWKAIPLKVSAFVWKALLDRLPTKDNLIKRGILHSQEDGVCSLCWVQDESSCHVLLICYEALLVWSKVCGWIDCSLLYAATLKEHFEEFVSFGVGKVKKKILGLIWQCVVWRIWKARNEKIFKNSIPIAENIVES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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