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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002925`

染色体: Chr02 坐标: 49662820-49665482 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002925`
名称	SmilChr02G002925
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49662820 - 49665482 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009661`
GeneID	`131009661`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009661`
原始查询	`LOC131009661`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=32; qcov=0.721; evalue=4.14e-96; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=37.4; qcov=0.738; evalue=5.57e-133; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009661

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793055.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793055.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793055.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793055.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793055.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49662847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr2:49662862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B91
`Chr2:49662878`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B62
`Chr2:49662878`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B62
`Chr2:49662936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B91
`Chr2:49663078`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A24,B104,B109,B123,B18,B26,B31,B5,B53,B6,B85,C19,C33,C50,C67,C75,C76,C84
`Chr2:49663090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:49663145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr2:49663182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:49663198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:49663214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C78
`Chr2:49663217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793055.1

798 aa

399

798

FAR1

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 70-158 aa PF10551 MULE 281-375 aa PF04434 SWIM 573-598 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793055.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	70	158	6.1e-17	62.8	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057793055.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	281	375	2.9e-26	92.4	MULE transposase domain
`XP_057793055.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	573	598	1.9e-08	34.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937072.1
ATGGTTATTGATTTGAATGTTAGTGATGACGGATTTGATGATGAAGAAATTGAGAATGATTTTGAGGGCAATGAATGTAGCTTGTCTGAAGAGATTATAGAATCAGATCTCCATCTGGAGTTTGAGTCATATAAGGCAATAAGAAATGAACTTGAGGAAAAATTGCAGGTTGGTGTTGTTTATGATAGTTTGGATGTGATTTATATTTTGTACTTACAATATGGTGTTTTAAGTGGATTTAGTATTAAGAAGGGAAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009661
ATGGTTATTGATTTGAATGTTAGTGATGACGGATTTGATGATGAAGAAATTGAGAATGATTTTGAGGGCAATGAATGTAGCTTGTCTGAAGAGATTATAGAATCAGATCTCCATCTGGAGTTTGAGTCATATAAGGCAATAAGAAATGAACTTGAGGAAAAATTGCAGGTTGGTGTTGTTTATGATAGTTTGGATGTGATTTATATTTTGTACTTACAATATGGTGTTTTAAGTGGATTTAGTATTAAGAAGGGAAGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793055.1
MVIDLNVSDDGFDDEEIENDFEGNECSLSEEIIESDLHLEFESYKAIRNELEEKLQVGVVYDSLDVIYILYLQYGVLSGFSIKKGSQKRFDNSDDLRLKVYNCSCEGYPDNKRSVGRIACYKKQVSRTNCKARLRVVRGEEGLWTVTVFFNQHNHELVSPDQCYTLRSARQMSHAKKSVLDALRSVGIKISSAYRFMEKEAGGRPNVGFTKKDAYAHVNLSKKQTKLENGDANALLKYFIGKGNSETNFYWNVDLDDDGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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