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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002943`

染色体: Chr02 坐标: 49932146-49933072 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002943`
名称	SmilChr02G002943
描述	uncharacterized SmilChr02G002943
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49932146 - 49933072 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009666`
GeneID	`131009666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009666`
原始查询	`LOC131009666`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=24.2; qcov=0.975; evalue=5.49e-10; confidence=weak
Rice	`Os06g0683500` - identity=30.7; qcov=0.622; evalue=7.04e-12; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793059.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793059.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057793059.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793059.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793059.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49932173`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B93,C2,C32,C36,C68
`Chr2:49932173`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B93,C2,C32,C36,C68
`Chr2:49932218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B99,C25,C5
`Chr2:49932434`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	89	A1,A11,A14,A15,A18,A2,A20,A23,A24,A3,A4,A6,A7,B1,B10,B102,B106,B11,B112,B113,B118,B121,B122,B126,B128,B13,B135,B138,B2,B24,B25,B28,B30,B33,B34,B38,B39,B45,B46,B5,B53,B61,B63,B67,B7,B70,B71,B74,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B89,B96,B97,B99,C13,C14,C15,C17,C19,C21,C22,C24,C25,C29,C3,C36,C43,C44,C45,C51,C53,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C71,C73,C81,C84,C86,D2,D3
`Chr2:49932460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:49932470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B74
`Chr2:49932471`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr2:49932471`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr2:49932474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:49932479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B131,B21,D10
`Chr2:49932489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B74
`Chr2:49932498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B62,B90

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793059.1

241 aa

120

241

RVT_3

PF13456 RVT_3 93-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793059.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	93	214	2.9e-15	57.0	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937076.1
ATGGTGCAGTTGTTCCTGCCATCTAAAGAGAACCTGCTTTCCAGAGGTGTTACGGTTGGAGGCGAGTGTGGTGTGTGTAAAGAAGGGAACAAGGCTTTATGGGAAGGGGTGCTGCCTAATCCGGTGCGCACTGTTGCACTGGCTGGAAGTTGCAGGGAAGAGTGGCTGAATGCTCACTCAACTGTCGGCCATGCTACAACAACTGGAGCTGCTGCCGCGGTCCCGCGTGGTTGCTCGGGCTGGCATAATATACCAGAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009666
ATGGTGCAGTTGTTCCTGCCATCTAAAGAGAACCTGCTTTCCAGAGGTGTTACGGTTGGAGGCGAGTGTGGTGTGTGTAAAGAAGGGAACAAGGCTTTATGGGAAGGGGTGCTGCCTAATCCGGTGCGCACTGTTGCACTGGCTGGAAGTTGCAGGGAAGAGTGGCTGAATGCTCACTCAACTGTCGGCCATGCTACAACAACTGGAGCTGCTGCCGCGGTCCCGCGTGGTTGCTCGGGCTGGCATAATATACCAGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793059.1
MVQLFLPSKENLLSRGVTVGGECGVCKEGNKALWEGVLPNPVRTVALAGSCREEWLNAHSTVGHATTTGAAAAVPRGCSGWHNIPEGSIRCGVDAAFFTSMNAMGIGIVIRDHEGNFLAGKSVKIRGLQAVDEGELMGIKEALSWLKELGLMHGSIESDSKLACDAINKNERSINEKGIIVACCRRDLVLLPDIRVMHIRRNQNAIAHCFAKAARDVAKLHVWNEPPSFVEGHLDPCSMLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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