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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002955`

染色体: Chr02 坐标: 50088647-50091298 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002955`
名称	SmilChr02G002955
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit B-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50088647 - 50091298 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009672`
GeneID	`131009672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009672`
原始查询	`LOC131009672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit B-like
产物	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit B-like
Arabidopsis	`AT5G08020` (RPA70B) RPA70-kDa subunit B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830696] identity=24; qcov=0.898; evalue=2.47e-21; confidence=weak
Rice	`Os07g0190600` - identity=21.8; qcov=0.939; evalue=1.07e-20; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006281 (DNA repair); GO:0006310 (DNA recombination)
KEGG	-
Pfam	PF02721 (DUF223)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793067.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793067.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793067.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793067.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793067.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50088783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:50088799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,D8
`Chr2:50088885`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A22,B11,B115,B121,B129,B53,B70,B81,B93,C26,C33,C42,C50,C83
`Chr2:50089026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:50089066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr2:50089066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:50089116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:50089166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:50089273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr2:50089391`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B29,B44,B73,B97,D8
`Chr2:50089391`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B29,B44,B73,B97,D8
`Chr2:50089411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793067.1

488 aa

244

488

DUF223

PF02721 DUF223 10-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793067.1`	Pfam	`PF02721`	DUF223	Domain	10	129	5.8e-16	59.4	Domain of unknown function DUF223

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937084.1
ATCAGTAATGTATCACGTAAAAAAAACTACCTTATGGATTGATTATATATTCACTATTCACAACAATCAAATTACAAAATACTGCGTATCATAAACATACATATCTTTACAAGATTCTGAAAATGCCACCGTTGTTCGGTCTGATCAAAGATCTGCAGCCAGGTAGAAGCAAGATAGCGTTGCAACTGAGACTAATCAGAAGCTATGATATTCTCAAGTTTGGCAACAAGAACGAAGCCTTTTCCCATGAAGTCATTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009672
ATGCCACCGTTGTTCGGTCTGATCAAAGATCTGCAGCCAGGTAGAAGCAAGATAGCGTTGCAACTGAGACTAATCAGAAGCTATGATATTCTCAAGTTTGGCAACAAGAACGAAGCCTTTTCCCATGAAGTCATTTTTCATGATAAAGAGGGAAATCGAGTTCATGCCACGATCAATCAATCATCAATTTCCAAAATCAAACCAATTCTAGAGCAGGGAAACATCTACACCATCAAAGATTACGTCATCACGACAAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793067.1
MPPLFGLIKDLQPGRSKIALQLRLIRSYDILKFGNKNEAFSHEVIFHDKEGNRVHATINQSSISKIKPILEQGNIYTIKDYVITTNNLKFKTTECKFKILLFRQTRITELEDDTFPNHMFNFKAFDDVAKMEEVQQASLFDLIGVIVSSYKPIEKDLNGKPTKLMDIVIEDLEGKTLSCTLWEQYADTMFEFLCSQPKMHVCIILQYCRPTMFRGEVRITSSYHITNIIFDENVAEIKEMKEKFAVIHKNRSISIKMVKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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