当前解析结果
SmilChr02G002985| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002985 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002985 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002985 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 50473138 - 50474582 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009678 |
|---|---|
| GeneID | 131009678 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009678 |
| 原始查询 | LOC131009678 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=36.6; qcov=0.479; evalue=2.94e-45; confidence=medium |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009678 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793073.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057793073.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793073.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793073.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057793073.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:50473151 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr2:50473168 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B85,C34,C40,C7 |
Chr2:50473186 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,C63 |
Chr2:50473193 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B21,B75,C34,C40,C7 |
Chr2:50473193 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B21,B75,C34,C40,C7 |
Chr2:50473194 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 45 | A1,A14,A20,A22,A8,A9,B10,B103,B111,B115,B119,B134,B14,B140,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B25,B45,B54,B59,B7,B71,B83,B88,B89,C15,C17,C19,C27,C30,C33,C40,C43,C53,C6,C61,C67,C68,C69,C7,C9 |
Chr2:50473249 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C4,C73 |
Chr2:50473307 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C29 |
Chr2:50473307 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C29 |
Chr2:50473392 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr2:50473433 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,B79,C15 |
Chr2:50473445 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B13,C4,C41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。