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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003008`

染色体: Chr02 坐标: 50713772-50715265 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003008`
名称	SmilChr02G003008
描述	uncharacterized SmilChr02G003008
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50713772 - 50715265 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009683`
GeneID	`131009683`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009683`
原始查询	`LOC131009683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G31430` (AT3G31430) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822909] identity=27.2; qcov=0.414; evalue=1.25e-11; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=30.2; qcov=0.447; evalue=3.61e-25; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009683

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793078.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057793078.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793078.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793078.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793078.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50713777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	143	A11,A14,A15,A19,A23,A24,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B103,B104,B105,B108,B11,B110,B115,B117,B118,B119,B121,B122,B123,B129,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B16,B18,B19,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B47,B54,B57,B61,B64,B68,B69,B7,B71,B72,B74,B75,B76,B78,B82,B9,B93,B94,B95,B96,B99,C11,C13,C15,C17,C19,C2,C21,C25,C26,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C53,C56,C57,C59,C60,C61,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C9,D10,D11,D5,D6,D7,D9
`Chr2:50713788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B54
`Chr2:50713814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B129,C49
`Chr2:50713893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C62,C67,D8
`Chr2:50713901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr2:50713904`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C85
`Chr2:50713904`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C85
`Chr2:50713932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,D6
`Chr2:50713960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A24
`Chr2:50713960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:50713991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C13,C26
`Chr2:50714018`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	39	A21,A22,A23,A24,B100,B101,B103,B109,B11,B115,B119,B138,B14,B16,B45,B47,B48,B55,B59,B64,B81,B87,B88,B98,C18,C27,C28,C31,C40,C45,C46,C50,C52,C53,C60,C7,C80,D2,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793078.1

497 aa

248

497

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 43-121 aa PF14392 zf-CCHC_4 178-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793078.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	43	121	3.2e-13	49.9	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057793078.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	178	224	6.1e-09	36.1	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937095.1
ATGGAGCGCGGAGGTCCGTCTCGGGATTCTGAGTTGTTGAGCGGCCCGGAAGAGCGTACTGAGCGAGAGTCGAATTTGATTGATATCTCCACCATTGTGAATACGGCCAATCAATCGGAAGACGGGTTTTGTTTGGTGGGCAGTCTCATTACTGCGAAGGCCCCAAATGGATTCCATTTAATGGAAATCATGAGGAAATCGTGGAAGACCTCAAAAAATTTCGAGGCTAAAGAATGGAGGAAGAATCTTTTTCTGTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009683
ATGGAGCGCGGAGGTCCGTCTCGGGATTCTGAGTTGTTGAGCGGCCCGGAAGAGCGTACTGAGCGAGAGTCGAATTTGATTGATATCTCCACCATTGTGAATACGGCCAATCAATCGGAAGACGGGTTTTGTTTGGTGGGCAGTCTCATTACTGCGAAGGCCCCAAATGGATTCCATTTAATGGAAATCATGAGGAAATCGTGGAAGACCTCAAAAAATTTCGAGGCTAAAGAATGGAGGAAGAATCTTTTTCTGTTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793078.1
MERGGPSRDSELLSGPEERTERESNLIDISTIVNTANQSEDGFCLVGSLITAKAPNGFHLMEIMRKSWKTSKNFEAKEWRKNLFLFSFATLEDRQWVLQRQPWHFDGHLFAVMGLDDSAQPSDIRVNRSSFWVRAYNLPIKCMNPSIIRNIGKQIGVVEEVDERANYAGCFARFKVNFDVTTPLLRGLTICLEAKQLWIPLKYEHLPTFCYKCGVMGHHSRACDINVEDDESGKQFEDIIYGPILKASPLKRLRPTKQNH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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