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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003069`

染色体: Chr02 坐标: 51555067-51558637 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003069`
名称	SmilChr02G003069
描述	uncharacterized SmilChr02G003069
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51555067 - 51558637 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009695`
GeneID	`131009695`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009695`
原始查询	`LOC131009695`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0946800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0946800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0946800` - identity=26.2; qcov=0.314; evalue=1.48e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009695

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793089.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793089.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057793089.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793089.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51555084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:51555102`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A10,A19,A24,A5,B1,B101,B104,B135,B21,B35,B46,B68,C40,C42,C43,C48,C62,C72,C74
`Chr2:51555116`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A24,A5,B1,B101,B104,B135,B21,B46,B68,C40,C42,C48,C72,C74
`Chr2:51555118`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A24,A5,B1,B101,B104,B135,B21,B46,B68,B8,C40,C42,C48,C72,C74
`Chr2:51555145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B31,B97
`Chr2:51555161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr2:51555174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr2:51555881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C75
`Chr2:51555933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:51555938`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A5,B140,C54
`Chr2:51555938`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A5,B140,C54
`Chr2:51555972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793089.1

716 aa

358

716

DUF8566

PF29561 DUF8566 95-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793089.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	95	297	3.8e-53	181.0	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937106.1
ATGGGTGATCCCGGCGACGGCTCTTACCCGACTGCAGGGCTCCTCGTGGTTGGGTGTTTCTCCTGTGAGCTCTCGTTTGAGCTCTCGGCGAAGGCTTCTTACAGGCTGGAGGACAAAAATGAAGAAAGCGAGAGTTCAGATGACGATGATTTTGAGGTTGTGCATCCAAGGGTTCAAATCGCGAACCTCATGGATGTACGGTGCAAACGAAGAGGAGTGAAGGAAAACTTTCCGAAGAAAAAAAAGGTCAGACAGATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009695
ATGGGTGATCCCGGCGACGGCTCTTACCCGACTGCAGGGCTCCTCGTGGTTGGGTGTTTCTCCTGTGAGCTCTCGTTTGAGCTCTCGGCGAAGGCTTCTTACAGGCTGGAGGACAAAAATGAAGAAAGCGAGAGTTCAGATGACGATGATTTTGAGGTTGTGCATCCAAGGGTTCAAATCGCGAACCTCATGGATGTACGGTGCAAACGAAGAGGAGTGAAGGAAAACTTTCCGAAGAAAAAAAAGGTCAGACAGATTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793089.1
MGDPGDGSYPTAGLLVVGCFSCELSFELSAKASYRLEDKNEESESSDDDDFEVVHPRVQIANLMDVRCKRRGVKENFPKKKKVRQIMASVPGLRTRTSPASLFKKISLMNEAQKQAVRDMGFGSVLQLGVRKLPGKLAFWVVEHFDCKSCSIVVGGNQGIRVDEDDVYRVYGFPKGKKEIEIFKRKHRSPLYDEWLAFFEDSTKDDIKITHVLDVMIERVDADIWFKRHFIIAMACCLIESMTSGTVHPYILNCLHDMDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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