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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003090`

染色体: Chr02 坐标: 51770533-51771081 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003090`
名称	SmilChr02G003090
描述	putative F-box protein At3g47150
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51770533 - 51771081 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009700`
GeneID	`131009700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009700`
原始查询	`LOC131009700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At3g47150
产物	putative F-box protein At3g47150
Arabidopsis	`AT3G16210` (AT3G16210) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820867] identity=25; qcov=0.967; evalue=4.1e-08; confidence=low
Rice	`Os12g0128000` (OsFbox638) - identity=25.9; qcov=1.04; evalue=2.34e-07; confidence=low
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793095.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793095.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793095.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793095.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51770965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,D3
`Chr2:51771055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793095.1

182 aa

182

F-box

FBA_3

PF00646 F-box 5-44 aa PF08268 FBA_3 90-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793095.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	5	44	2.5e-06	27.9	F-box domain
`XP_057793095.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	90	178	1.1e-09	38.4	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937112.1
ATGAAGTCAGATCTCTTCAAACTACCGTCAGAAATCATCACCAATATCCTTTTAAGACTCTCTGTTCGAAGCATTGCAGTAAGCAAGTGCGTTTGCAAAGCATTGCTCCATTTGCTCGACACCCACGATTTCGCCAAGTTGCATTTTTCCAAATCCGTCCCCGCCCTAGCTATCACGATGCGGACGAAAGGTTCATATTGCCTCAAAATTTCGGAATTGGAAGAAGACGAAATCGATCCCGAGAGCCACGATCTACTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009700
ATGAAGTCAGATCTCTTCAAACTACCGTCAGAAATCATCACCAATATCCTTTTAAGACTCTCTGTTCGAAGCATTGCAGTAAGCAAGTGCGTTTGCAAAGCATTGCTCCATTTGCTCGACACCCACGATTTCGCCAAGTTGCATTTTTCCAAATCCGTCCCCGCCCTAGCTATCACGATGCGGACGAAAGGTTCATATTGCCTCAAAATTTCGGAATTGGAAGAAGACGAAATCGATCCCGAGAGCCACGATCTACTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793095.1
MKSDLFKLPSEIITNILLRLSVRSIAVSKCVCKALLHLLDTHDFAKLHFSKSVPALAITMRTKGSYCLKISELEEDEIDPESHDLLTKINFSPDATLGGSANGLLFLLDYRNSCVSICNPITREFYFIRSRQLSSHGFGVSRISGQHKLVCIDPLGDRGFSCYVYTLGTGSWRRVEANDSFG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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