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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003109`

染色体: Chr02 坐标: 52073719-52074792 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003109`
名称	SmilChr02G003109
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52073719 - 52074792 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009705`
GeneID	`131009705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009705`
原始查询	`LOC131009705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=43.5; qcov=1.06; evalue=3.51e-73; confidence=medium
Rice	`Os01g0694000` - identity=46; qcov=0.926; evalue=2.83e-88; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793099.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793099.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793099.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793099.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793099.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52073725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B24,B41,C29
`Chr2:52073752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B103,B117,B24,B41,C29,C36,C6
`Chr2:52073858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:52074007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B124,B27,D11
`Chr2:52074011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,D11
`Chr2:52074022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A19,B128,B19,B35,B62,B66,B78,B99,C27,C28,C30,C35,C47,C62,C68,C82,C84
`Chr2:52074101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A13,B117,B132,B9,C27,C53,C67
`Chr2:52074191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B5,B64,B82
`Chr2:52074193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B61,B64,C18,C28,C29
`Chr2:52074285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B117,C27,C53,C67
`Chr2:52074346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B125,B126,C1
`Chr2:52074537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793099.1

326 aa

163

326

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 45-315 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 48-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793099.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	45	315	5.6e-46	157.8	Protein kinase domain
`XP_057793099.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	48	317	2.4e-48	165.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937116.1
ATGGCTGTCGTGGCGCTGCTGCTAATAAGGAAACGAGGGAAGAAGAATGTACAACCCCTTCCTGAGAATTTACTAGGCGTCTCTTGGAGGCGAATTTCGTACGTAGAACTCGAGCGAGGAACAAGTTCTTTTAGCGAAACGAATCTACTTGGAAGAGGAAGCTTTGGTTCGGTATATAAAGGGATACTTTCTGATGGATTAAATCTTGCGGTGAAACTGTTCAATCTAGAGTTAAAAGGAGCTAGCTATAGCTTCAATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009705
ATGGCTGTCGTGGCGCTGCTGCTAATAAGGAAACGAGGGAAGAAGAATGTACAACCCCTTCCTGAGAATTTACTAGGCGTCTCTTGGAGGCGAATTTCGTACGTAGAACTCGAGCGAGGAACAAGTTCTTTTAGCGAAACGAATCTACTTGGAAGAGGAAGCTTTGGTTCGGTATATAAAGGGATACTTTCTGATGGATTAAATCTTGCGGTGAAACTGTTCAATCTAGAGTTAAAAGGAGCTAGCTATAGCTTCAATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793099.1
MAVVALLLIRKRGKKNVQPLPENLLGVSWRRISYVELERGTSSFSETNLLGRGSFGSVYKGILSDGLNLAVKLFNLELKGASYSFNTESEILSSLRHRNLVQIIGCCVNAEFRALILEYMSNGSLEKWLHSDNYCLDLLHSLQIAIDVALALEYLHHGHTFPVVHCDVKPSNVLLDEDMTARVGDFGISKLFDGGEAMVQTQTVATIGYAAPEYGSEGKVSTKGDVYSYGILLLEMFTGKKPTDDMFDGKMGLRECVSEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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