当前解析结果
SmilChr02G003111| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003111 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003111 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G003111 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 52085105 - 52086538 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009706 |
|---|---|
| GeneID | 131009706 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009706 |
| 原始查询 | LOC131009706 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=38.9; qcov=0.196; evalue=1.12e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009706 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057793100.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057793100.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057793100.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793100.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793100.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:52085323 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,C20 |
Chr2:52085339 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:52085342 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B16,B84,C34,C50,C54 |
Chr2:52085383 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr2:52085393 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B54,C39 |
Chr2:52085396 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B54,C39 |
Chr2:52085419 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C34 |
Chr2:52085452 |
GTC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 15 | A15,A19,B114,B14,B45,B48,B51,B8,C29,C3,C52,C58,C65,C7,C9 |
Chr2:52085456 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 15 | A15,A19,B114,B14,B45,B48,B51,B8,C29,C3,C52,C58,C65,C7,C9 |
Chr2:52085470 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr2:52085498 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B43,C52 |
Chr2:52085503 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B1,C28,C78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。