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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003119`

染色体: Chr02 坐标: 52210869-52212002 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003119`
名称	SmilChr02G003119
描述	pyruvate kinase 1, cytosolic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52210869 - 52212002 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009707`
GeneID	`131009707`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009707`
原始查询	`LOC131009707`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pyruvate kinase 1, cytosolic-like
产物	pyruvate kinase 1%2C cytosolic-like
Arabidopsis	`AT3G52990` (AT3G52990) Pyruvate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824465] identity=82.9; qcov=0.99; evalue=8.68e-116; confidence=high
Rice	`Os11g0148500` (OsPK1) - identity=85; qcov=0.99; evalue=9.12e-119; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004743 (pyruvate kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0030955 (potassium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00224 (PK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009707

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793101.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793101.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793101.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793101.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52211046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B76
`Chr2:52211096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B120,B41,B69,B84,B86,C1,C10,C11,C32,C70,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793101.1

195 aa

195

PF00224 PK 1-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793101.1`	Pfam	`PF00224`	PK	Domain	1	132	1.4e-42	146.7	Pyruvate kinase, barrel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937118.1
ATGAGGCGTGCTGAGGACATCAAACTTGCACGCGAGTTTCTTTCTACGTTGGGTGACCTCAACCAGACTCTGATCTTTGCAAAGATCGACAATGTGGAGGGAATGACTCATTTTGATAATCTCCTTGAAAAAGCTGATGGAATTATCCTCTCTCGTGGGAATCTTGGGATCGATCTCCCACCAGAGAAGGTGTTTTTGTTCCAGAAGGAAGCTGTTCACAAGTGCAACATGGCAGGGAAGCCGGCAGTGGTGACTCGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009707
ATGAGGCGTGCTGAGGACATCAAACTTGCACGCGAGTTTCTTTCTACGTTGGGTGACCTCAACCAGACTCTGATCTTTGCAAAGATCGACAATGTGGAGGGAATGACTCATTTTGATAATCTCCTTGAAAAAGCTGATGGAATTATCCTCTCTCGTGGGAATCTTGGGATCGATCTCCCACCAGAGAAGGTGTTTTTGTTCCAGAAGGAAGCTGTTCACAAGTGCAACATGGCAGGGAAGCCGGCAGTGGTGACTCGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793101.1
MRRAEDIKLAREFLSTLGDLNQTLIFAKIDNVEGMTHFDNLLEKADGIILSRGNLGIDLPPEKVFLFQKEAVHKCNMAGKPAVVTRVVDSMADNLRPTRAEATDVANAVLDGSDAILLGAETVRGFYPVETISVVRKICAEAEKVYNQNLYFKKTVKFVGEPMSHLESIASSAVRAAIKVKASVIICFTSSRKSC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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