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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003143`

染色体: Chr02 坐标: 52439416-52440293 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003143`
名称	SmilChr02G003143
描述	beta-amyrin 6-beta-monooxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52439416 - 52440293 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009719`
GeneID	`131009719`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009719`
原始查询	`LOC131009719`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-amyrin 6-beta-monooxygenase-like
产物	beta-amyrin 6-beta-monooxygenase-like
Arabidopsis	`AT5G36140` (CYP716A2) cytochrome P450, family 716, subfamily A, polypeptide 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833611] identity=32.8; qcov=0.601; evalue=1.35e-14; confidence=low
Rice	`Os04g0469800` (D11) - identity=35.6; qcov=0.512; evalue=7.07e-10; confidence=low
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009719

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793110.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057793110.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793110.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793110.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52439466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,B94,C74
`Chr2:52439505`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A23,B106,B136,B48,B55,B68,B8,B89,B97,C2,C32,C68,C71,C8,C82,D11
`Chr2:52439530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:52439546`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	76	A1,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A9,B104,B105,B110,B111,B112,B113,B119,B121,B123,B125,B126,B127,B134,B138,B140,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B3,B31,B33,B40,B42,B43,B44,B45,B48,B5,B52,B53,B61,B7,B71,B72,B80,B85,B86,B88,B98,C16,C17,C19,C22,C29,C38,C39,C40,C41,C42,C47,C55,C6,C60,C62,C64,C66,C75,C81,C9,D1,D10,D7,D9
`Chr2:52439658`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A10,A14,A18,A2,A20,A22,A25,A3,A4,B1,B105,B109,B113,B120,B122,B124,B127,B128,B13,B133,B14,B16,B26,B27,B30,B36,B37,B38,B39,B43,B51,B56,B58,B60,B63,B64,B67,B70,B75,B77,B79,B81,B83,B84,B91,B96,C1,C10,C11,C14,C18,C25,C32,C33,C34,C36,C37,C40,C42,C43,C48,C49,C50,C51,C56,C57,C58,C60,C61,C64,C66,C68,C69,C7,C76,C87,C9,D2,D4,D8
`Chr2:52439661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C14,C83
`Chr2:52439715`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B34,B38,B39,B67,B93,B97,C13,C59,C84
`Chr2:52439729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr2:52439730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,B94,C74
`Chr2:52439741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C45,D3
`Chr2:52440106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B47
`Chr2:52440128`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	32	A8,B100,B126,B138,B15,B17,B20,B25,B36,B41,B57,B59,B6,B62,B77,B82,B90,B92,C21,C35,C39,C47,C51,C54,C56,C63,C70,C72,C81,C84,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793110.1

203 aa

102

203

p450

PF00067 p450 89-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793110.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	89	188	3.2e-08	33.5	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937127.1
ATGGCGACCTTCATTCTTTATGTTCTTCCTCTTCTACTTCTCCCTCTCTATCTATATCTCATCTTCTTCACCCCCAAAAAGAGCTCCGACGATCTGAAAAACCTACTTCCCGGCTCCAAGGGCTGGCCAGTTCTCGGAGAAACCGTGGAGCTGGCCTTGGTAGGCTTATCCAAATTCGTTGTTGGGGGAAAATCTAGTGGTTTTCTGCGGTGCAAAAGGGTGTTCATGGAGAAGCTGTTGGAGCCCTTCTCTCAGATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009719
ATGGCGACCTTCATTCTTTATGTTCTTCCTCTTCTACTTCTCCCTCTCTATCTATATCTCATCTTCTTCACCCCCAAAAAGAGCTCCGACGATCTGAAAAACCTACTTCCCGGCTCCAAGGGCTGGCCAGTTCTCGGAGAAACCGTGGAGCTGGCCTTGGTAGGCTTATCCAAATTCGTTGTTGGGGGAAAATCTAGTGGTTTTCTGCGGTGCAAAAGGGTGTTCATGGAGAAGCTGTTGGAGCCCTTCTCTCAGATGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793110.1
MATFILYVLPLLLLPLYLYLIFFTPKKSSDDLKNLLPGSKGWPVLGETVELALVGLSKFVVGGKSSGFLRCKRVFMEKLLEPFSQMASGLISLPGTAFNRGVRGGKAVRGQLLRIVEERRRKGSEGGDCWLSKLLLLTDEDGKHLSDRKIANFFLGLLLGSYEATAYTITAVIYYLAQLPHIYQQVFEGENRIDRLYLLLGIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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