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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003158`

染色体: Chr02 坐标: 52616406-52617845 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003158`
名称	SmilChr02G003158
描述	uncharacterized SmilChr02G003158
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52616406 - 52617845 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009724`
GeneID	`131009724`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009724`
原始查询	`LOC131009724`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=32.4; qcov=0.846; evalue=3.31e-56; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009724

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793115.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793115.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793115.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793115.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52616445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:52616454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B71,C45
`Chr2:52616471`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B129,B91
`Chr2:52616471`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B129,B91
`Chr2:52616486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:52616489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:52616538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B32,B37,C70
`Chr2:52616604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,B95,C14,C83
`Chr2:52616616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B110,B76,B98,C26,C37,C5
`Chr2:52616630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr2:52616640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C38,C43
`Chr2:52616674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793115.1

479 aa

240

479

RVT_1

PF00078 RVT_1 347-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793115.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	347	461	3.3e-28	99.7	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937132.1
ATGAGCGAGTGTCCGAATCGGCGCATTATGATCCTCCGAGACGATGGAGATGTTGTCACCGATGGGGAAGAGACAGACCCTGAGATGCCTGAATTGGAAGAACCCGAGGAAGAGGTAGAGCTGGATGCACTCAAGGGACACTTCCTAGTAGCCCGGCGAGCTTTGACCATGCAACCGCAAACGGATGAACTGGAGCAGCGGGAAAACCTTTTTCACACGCGGTGTTTGGTCCGTGACAAGCTCTGCAGTGTGATTATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009724
ATGAGCGAGTGTCCGAATCGGCGCATTATGATCCTCCGAGACGATGGAGATGTTGTCACCGATGGGGAAGAGACAGACCCTGAGATGCCTGAATTGGAAGAACCCGAGGAAGAGGTAGAGCTGGATGCACTCAAGGGACACTTCCTAGTAGCCCGGCGAGCTTTGACCATGCAACCGCAAACGGATGAACTGGAGCAGCGGGAAAACCTTTTTCACACGCGGTGTTTGGTCCGTGACAAGCTCTGCAGTGTGATTATTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793115.1
MSECPNRRIMILRDDGDVVTDGEETDPEMPELEEPEEEVELDALKGHFLVARRALTMQPQTDELEQRENLFHTRCLVRDKLCSVIIDGGSCTNVASKHMVEKLGLTAVKHPKPYHLQWLSDAGNVRVTSQVRVPLRLGRYEDEVLCDVIPMQACHILLGRPWQFDRRTHDGFTNKYSFEFQHKRMSLVHLSPQQVYEDQVQLLKEATTTQNRAQQVEAKPMAVTHRSFLARPCDIKLCVKEERPMVLLQFRETLFTANDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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