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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003215`

染色体: Chr02 坐标: 53333452-53334867 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003215`
名称	SmilChr02G003215
描述	uncharacterized SmilChr02G003215
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53333452 - 53334867 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009738`
GeneID	`131009738`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009738`
原始查询	`LOC131009738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G15685` (AT5G15685) mutator transposase MUDRA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721163] identity=29.6; qcov=0.698; evalue=1.49e-31; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=33; qcov=0.945; evalue=4.29e-48; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009738

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793129.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793129.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793129.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793129.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793129.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53333494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B1,B100
`Chr2:53333494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B100
`Chr2:53333535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B55,C47,C8
`Chr2:53333659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A22,B129,B2,B49,B55,B77,C21,C40,C5
`Chr2:53333667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:53333678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr2:53333767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:53333786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr2:53333980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:53334031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr2:53334071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B113,B66,C4
`Chr2:53334091`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A25,B12,C12,C49,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793129.1

401 aa

200

401

DBD_Tnp_Mut

PF03108 DBD_Tnp_Mut 119-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793129.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	119	177	2.5e-07	31.0	MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937146.1
ATGATGAGCATGCTAAGAAGAGATCCCATTCCCCATATTACACCATTGCCTTTATTTGATGAGGAAAAGGAAGGTAATGACTTAGAGGATATCCATGGACTGGAGATTAAAAATGATGGTGAGGGGATTGATGATGCAGAGATTGGGGAAGGGATAGAGCTAGGAGAAAGTGGATTAGATGGACAGGAGGGGAGGGATGCAAGTGAAGAGGATAATGAAGATGATCCATTAGGTCTCGGTGATGGTTCAGAGACAGACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009738
ATGATGAGCATGCTAAGAAGAGATCCCATTCCCCATATTACACCATTGCCTTTATTTGATGAGGAAAAGGAAGGTAATGACTTAGAGGATATCCATGGACTGGAGATTAAAAATGATGGTGAGGGGATTGATGATGCAGAGATTGGGGAAGGGATAGAGCTAGGAGAAAGTGGATTAGATGGACAGGAGGGGAGGGATGCAAGTGAAGAGGATAATGAAGATGATCCATTAGGTCTCGGTGATGGTTCAGAGACAGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793129.1
MMSMLRRDPIPHITPLPLFDEEKEGNDLEDIHGLEIKNDGEGIDDAEIGEGIELGESGLDGQEGRDASEEDNEDDPLGLGDGSETDSSTYSQDLTESDEELVKAAVVGDIEQGVQGHFELGMTFAGAKEVRDALNTYSVNFGYKLKFLKNEPKRVRVVCIGDSTCPFLFLASKDGDTEGLIVKTLVAEHTCCRQRQVPSASQAYLANFFKDAIYRNPRFTSKDIQGHVKDHLKLHVSLGKCKRAKRTILNALQGSYVEEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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