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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003219`

染色体: Chr02 坐标: 53366013-53373533 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003219`
名称	SmilChr02G003219
描述	uncharacterized SmilChr02G003219
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53366013 - 53373533 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009739`
GeneID	`131009739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009739`
原始查询	`LOC131009739`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=42; qcov=0.407; evalue=1.17e-13; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=47.6; qcov=0.671; evalue=7.02e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793130.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793130.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057793130.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793130.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793130.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53366082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr2:53366085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C1,C67
`Chr2:53366099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:53366100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C64
`Chr2:53366100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr2:53366108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B81,C20,C6
`Chr2:53366129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr2:53366151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C27
`Chr2:53366160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr2:53366169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B138,C65,D3,D8
`Chr2:53366189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B34,B36,C1,C15
`Chr2:53366191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,A7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793130.1

216 aa

108

216

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 149-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793130.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	149	216	2e-14	54.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937147.1
ATGGTGGAGAAGGCGGCGTATGCCTTCGGCGAAGATCTGGGCAACGCCAAGTTCAATTTCCCCGAAAATCCACCGAAGATCGAGATCCAGGTTGCCGCCGGCCGCTTTGCCCTTGCGTCCACCGGCGCCGAGACCTCGGGTCAGGTCGACGATCTCGACTCCCAGTCGAACTCGCTCTCCTCGTCAAAGGCACTGCAGTACGCTGAGTCGCCGTGCCCGTCGATCGTCAACGCCGTGCAGTCCGATCATTACTTCCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009739
ATGGTGGAGAAGGCGGCGTATGCCTTCGGCGAAGATCTGGGCAACGCCAAGTTCAATTTCCCCGAAAATCCACCGAAGATCGAGATCCAGGTTGCCGCCGGCCGCTTTGCCCTTGCGTCCACCGGCGCCGAGACCTCGGGTCAGGTCGACGATCTCGACTCCCAGTCGAACTCGCTCTCCTCGTCAAAGGCACTGCAGTACGCTGAGTCGCCGTGCCCGTCGATCGTCAACGCCGTGCAGTCCGATCATTACTTCCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793130.1
MVEKAAYAFGEDLGNAKFNFPENPPKIEIQVAAGRFALASTGAETSGQVDDLDSQSNSLSSSKALQYAESPCPSIVNAVQSDHYFQQSSDDELGTSTFTPLQKCTVVIRQLAYGGATNQYDEYLRIAESTSLECLSKSCRVIVQLFSAEYLRRLMSADCQRLFALHEYGSGDARKPRLHHWAWKDCPVAWQGAYIRGDQGEPTIFLEAVASQDMWI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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