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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003265`

染色体: Chr02 坐标: 53924061-53925012 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003265`
名称	SmilChr02G003265
描述	uncharacterized SmilChr02G003265
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53924061 - 53925012 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009742`
GeneID	`131009742`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009742`
原始查询	`LOC131009742`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=26.7; qcov=0.456; evalue=6.29e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.1; qcov=0.655; evalue=4.35e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009742

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793134.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793134.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793134.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793134.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793134.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53924095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:53924099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:53924142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C33,C78
`Chr2:53924144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C87
`Chr2:53924148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A1,A14,B102,B107,B124,B128,B134,B34,B39,B51,B56,B57,B65,B66,B69,C12,C26,C28,C3,C30,C31,C37,C41,C46,C48,C49,C5,C50,C67,C7,C72,C78,C85,C87,D2,D9
`Chr2:53924251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:53924255`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A10,A14,A25,B111,B123,B138,B62,B81,B88,B9,C1,C17,C27,C40,C5,C57,C6,C64,C65,C80,C86,C9,D3
`Chr2:53924267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B73,C38,C46
`Chr2:53924280`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A4,B1,B68,B80
`Chr2:53924280`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A4,B1,B68,B80
`Chr2:53924298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B24
`Chr2:53924298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793134.1

287 aa

144

287

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 92-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793134.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	92	184	4.3e-13	50.4	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937151.1
ATGGTGGTCCAAAATTGTTGGGAGGGCGGGGGGAGAGGGAGAGAAGTGGTTCTGGAGCAATGTCCAAAGGATCCTGGGGAACGGGAGCGAGGTAGTGTTGAGGGGGCCGGGAAAAGGACGGAGGTTGGGTGGGTGTGGGACCTTAAGTGGCGAAGGGATTTGAGGGAGAGGGAGAAGGAGATGGAGGCGAACTTGATGGCTGTCATTGGTGTTTGTTCTCCTTGCCCAAACAAACAGGACGGCTGGAATTGGAAGAGTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009742
ATGGTGGTCCAAAATTGTTGGGAGGGCGGGGGGAGAGGGAGAGAAGTGGTTCTGGAGCAATGTCCAAAGGATCCTGGGGAACGGGAGCGAGGTAGTGTTGAGGGGGCCGGGAAAAGGACGGAGGTTGGGTGGGTGTGGGACCTTAAGTGGCGAAGGGATTTGAGGGAGAGGGAGAAGGAGATGGAGGCGAACTTGATGGCTGTCATTGGTGTTTGTTCTCCTTGCCCAAACAAACAGGACGGCTGGAATTGGAAGAGTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793134.1
MVVQNCWEGGGRGREVVLEQCPKDPGERERGSVEGAGKRTEVGWVWDLKWRRDLREREKEMEANLMAVIGVCSPCPNKQDGWNWKSTAGGIFSTKAAYSECAKAEGDHTGEFQEVKAQLWAAPAPHKARVTAWRSICNRLPTCDNLIKRNVMIPVEEQWCNACVLREETVDHSLLHCPKVDCVWDQIHQWIGIETVKPQRVEEHFKSFIGGGRGKRNRNFLKALWIGTVWAVWKYRNESRFENKTWEASNLVKDIKGRLW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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