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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003278`

染色体: Chr02 坐标: 54072679-54073830 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003278`
名称	SmilChr02G003278
描述	uncharacterized protein At4g02000-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54072679 - 54073830 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009743`
GeneID	`131009743`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009743`
原始查询	`LOC131009743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719410]; symbol=AT3G57587; hit=AT3G57587; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719410]; symbol=AT3G57587; hit=AT3G57587; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G57587` (AT3G57587) Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719410] identity=24.2; qcov=0.755; evalue=1.32e-22; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=28.8; qcov=0.499; evalue=5.63e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009743

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793135.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793135.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057793135.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793135.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793135.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54072686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:54072694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:54072699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B54,C15,C26,C44
`Chr2:54072722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:54072750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B94,C77,D4,D5
`Chr2:54072819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B35,C49
`Chr2:54072819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C49
`Chr2:54072963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:54072967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr2:54072973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D10
`Chr2:54072985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,D6
`Chr2:54073008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793135.1

383 aa

192

383

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 32-106 aa PF14392 zf-CCHC_4 172-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793135.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	32	106	3.3e-18	65.9	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057793135.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	172	217	2.4e-18	66.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937152.1
ATGGAGGATCATATGGCTGGATTAAATCTTGCTAATGAGGATGATGAACTTTTACTCGACGATGCAATTACCGGAGATTCCTCCATTGCAGTTGAGTTATGTTTGGTGGGTAAATTTCTTACGGATCAACCTATTAACTTCAATCTGATGCGAAGTCGTCTTGCGAGTATTTGGAGGCCAGGGAAAGGAGTTTTCATGAAGGACATTGGCCAAGGGCGTTTTATCTTTCAGTTCTTCCATGAGATCGACCTGCAACGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009743
ATGGAGGATCATATGGCTGGATTAAATCTTGCTAATGAGGATGATGAACTTTTACTCGACGATGCAATTACCGGAGATTCCTCCATTGCAGTTGAGTTATGTTTGGTGGGTAAATTTCTTACGGATCAACCTATTAACTTCAATCTGATGCGAAGTCGTCTTGCGAGTATTTGGAGGCCAGGGAAAGGAGTTTTCATGAAGGACATTGGCCAAGGGCGTTTTATCTTTCAGTTCTTCCATGAGATCGACCTGCAACGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793135.1
MEDHMAGLNLANEDDELLLDDAITGDSSIAVELCLVGKFLTDQPINFNLMRSRLASIWRPGKGVFMKDIGQGRFIFQFFHEIDLQRVADGGPWAFGNFPLMLHRLKRGEFPLTVPLETLPFWIQVHDLPAGYLTEGVGRLLGNFIGNFLEYDSTNASGVWRQYMRIRVGIRISEPLKRFKRIKQKDGSSFVVNFRYERLNIFCFLCGRLGHSESFCELMFNPISKNVEREWGVWLKAADRRGVNLAGDKWLRTDDTMANP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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