当前解析结果
SmilChr02G003279| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003279 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003279 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G003279 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 54083699 - 54084713 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009744 |
|---|---|
| GeneID | 131009744 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009744 |
| 原始查询 | LOC131009744 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os09g0122300; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os09g0122300; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os09g0122300- identity=39.3; qcov=0.22; evalue=7.28e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009744 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057793136.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057793136.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057793136.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793136.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793136.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:54083698 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A3,B103,B131,B26,B33,B72,B82,B91,C1,C48,C74,C87,D2 |
Chr2:54083710 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,B107,B29 |
Chr2:54083713 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr2:54083747 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B100 |
Chr2:54083752 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:54083758 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B65,B95,C71 |
Chr2:54083762 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B50,C23,C57 |
Chr2:54083768 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr2:54083769 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A25 |
Chr2:54083777 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | A2,B122,B82,C60 |
Chr2:54083777 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B122,B82,C60 |
Chr2:54083815 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B100,C77 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。