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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003370`

染色体: Chr02 坐标: 54826906-54827685 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003370`
名称	SmilChr02G003370
描述	uncharacterized SmilChr02G003370
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54826906 - 54827685 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009756`
GeneID	`131009756`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009756`
原始查询	`LOC131009756`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=26.9; qcov=0.575; evalue=1.67e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=24.7; qcov=0.907; evalue=8.59e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009756

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793148.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793148.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793148.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793148.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54826912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C55
`Chr2:54826917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C68
`Chr2:54826932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C53,C64,C9
`Chr2:54826934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B86,C37,D9
`Chr2:54826958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A14,A22,A23,A5,A9,B101,B114,B12,B120,B29,B36,B40,B45,B59,B60,B62,B63,B87,B91,C31,C41,C49,C53,C63,C67,C7,C75,C82
`Chr2:54826971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:54827005`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B100,B88
`Chr2:54827005`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B100,B88
`Chr2:54827010`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B100,B88
`Chr2:54827010`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B100,B88
`Chr2:54827038`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A24,A4,B7,B93,C23,C36,C38
`Chr2:54827042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B37,B58,B95,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793148.1

259 aa

130

259

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 60-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793148.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	60	154	1.1e-15	58.7	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937165.1
ATGAAGGAGATGGGAAGATGGTCTAACGGGAGATGGGTCTGGGATTTCCAGTGGAGGAGAGACCTCTTGGACAGAGAGCTCGAAGTGGTGCAGTCGCTGACCACTTTCATCTCTGAAGTCTCGCCTAAATTTGATTGCGAAGATCGCTGGGAGTGGAGAGGGCACAAGAGTGGGACGTACACAACAAACTCGGCCTACCGAATTATCAAGAGCCTTAAAGAAGACAAGGCCGAGCTTCCTCTTGCAGTGATGGCAGCTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009756
ATGAAGGAGATGGGAAGATGGTCTAACGGGAGATGGGTCTGGGATTTCCAGTGGAGGAGAGACCTCTTGGACAGAGAGCTCGAAGTGGTGCAGTCGCTGACCACTTTCATCTCTGAAGTCTCGCCTAAATTTGATTGCGAAGATCGCTGGGAGTGGAGAGGGCACAAGAGTGGGACGTACACAACAAACTCGGCCTACCGAATTATCAAGAGCCTTAAAGAAGACAAGGCCGAGCTTCCTCTTGCAGTGATGGCAGCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793148.1
MKEMGRWSNGRWVWDFQWRRDLLDRELEVVQSLTTFISEVSPKFDCEDRWEWRGHKSGTYTTNSAYRIIKSLKEDKAELPLAVMAARKIWKSPAPHKARMTAWRALFNRLPTCNNLVKRQIDVGVVERNCNGCFAQEETANHILLRCPKIDGIWNNMYAWLGFQSVRPFAIPDHFLSFSQLGSSKNSGRFLSALWSCIVWVVWRRRNESRFDDKSWEIDQVVLEIKARMWSWNSIFDILGGELSFREWCSSSICSLLCK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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