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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003443`

染色体: Chr02 坐标: 55704768-55706540 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003443`
名称	SmilChr02G003443
描述	uncharacterized SmilChr02G003443
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55704768 - 55706540 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009764`
GeneID	`131009764`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009764`
原始查询	`LOC131009764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=26.8; qcov=0.449; evalue=6.58e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009764

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793156.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793156.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793156.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793156.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793156.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55704850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr2:55704851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B76,C19,C47
`Chr2:55704863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C19
`Chr2:55704869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	83	A16,A18,A19,A22,A23,A3,A4,B101,B103,B105,B119,B124,B128,B13,B132,B135,B136,B139,B21,B24,B28,B3,B31,B32,B34,B38,B40,B41,B42,B43,B48,B5,B50,B51,B53,B54,B56,B58,B6,B61,B63,B64,B65,B69,B7,B74,B76,B78,B8,B80,B83,B88,B96,B97,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C21,C25,C26,C27,C30,C31,C32,C35,C38,C49,C57,C59,C6,C61,C63,C64,C68,C7,C71,C74,C77,C84,C87
`Chr2:55704903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C71
`Chr2:55704922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B59
`Chr2:55704927`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A7,B42,C38
`Chr2:55704927`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A7,B42,C38
`Chr2:55704944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A21,B69
`Chr2:55704949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B42,C38,C43
`Chr2:55704954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B42,C38,C43,C71
`Chr2:55704984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B42,C38,C43,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793156.1

590 aa

295

590

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 62-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793156.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	62	131	1.3e-08	35.8	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937173.1
ATGTCAAACACCATCCAGAATTTAGACCCCGCCTTGGCTAGAAGATTGGCGGATATGGAGGCCATCATCCAACGAATCCCAGGAGTCCCGGCCCCAATCAAGAAAAGCGCAGAGAGCTGTTATGCTGACTCGCCCTTTGTGGACGAAATAGCTTTGGTGGAAATGCCGAGGAAGTTCAGCTTCCTCCATATGAAGATGTTTGATGGCGCGTTTGACCCAGACGACCATATCGCCCAATATCGACAGAGGATGTTCACCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009764
ATGTCAAACACCATCCAGAATTTAGACCCCGCCTTGGCTAGAAGATTGGCGGATATGGAGGCCATCATCCAACGAATCCCAGGAGTCCCGGCCCCAATCAAGAAAAGCGCAGAGAGCTGTTATGCTGACTCGCCCTTTGTGGACGAAATAGCTTTGGTGGAAATGCCGAGGAAGTTCAGCTTCCTCCATATGAAGATGTTTGATGGCGCGTTTGACCCAGACGACCATATCGCCCAATATCGACAGAGGATGTTCACCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793156.1
MSNTIQNLDPALARRLADMEAIIQRIPGVPAPIKKSAESCYADSPFVDEIALVEMPRKFSFLHMKMFDGAFDPDDHIAQYRQRMFTVAIPRDMREACGSSLIGPALQWYTNLPNNSISSFTQLTDVFVQQYASSRKLEKILEDLYAIVQRHGEPLRDYIGRFNKEKVSITNCSEQTAVTAFRKGLLPGSDLYKTLTKYPCKTMEDVLIQAWAQIKWEEDQYNMQRVFPPSRSEKDHQVDRRSGRDRRAEPYPPYRQSRGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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