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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003501`

染色体: Chr02 坐标: 56215152-56215778 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003501`
名称	SmilChr02G003501
描述	uncharacterized SmilChr02G003501
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56215152 - 56215778 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009774`
GeneID	`131009774`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009774`
原始查询	`LOC131009774`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=46.9; qcov=0.942; evalue=1.21e-58; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009774

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793165.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793165.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793165.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793165.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793165.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56215166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C33,C56
`Chr2:56215173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C71
`Chr2:56215201`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B108,B111,B118,B126,B127,B18,B22,B4,C28,C46,C70,D9
`Chr2:56215217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	96	A11,A21,A3,A8,A9,B101,B104,B106,B112,B113,B120,B124,B127,B131,B133,B134,B135,B138,B14,B140,B16,B18,B2,B20,B22,B27,B3,B32,B36,B40,B41,B42,B44,B47,B48,B59,B61,B62,B65,B67,B69,B74,B76,B77,B78,B8,B84,B86,B87,B88,B90,B92,B94,C1,C15,C17,C18,C19,C20,C23,C28,C29,C3,C31,C32,C33,C36,C38,C50,C51,C53,C54,C56,C57,C58,C6,C61,C63,C65,C68,C69,C7,C74,C75,C8,C80,C82,C84,C85,C9,D1,D10,D11,D6,D8,D9
`Chr2:56215220`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A11,B124,B131,B133,B135,B140,B18,B2,B20,B41,B42,B44,B61,B69,B74,B77,B78,B8,B86,C15,C18,C20,C23,C32,C36,C51,C68,C82,D10
`Chr2:56215224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr2:56215228`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A6,B103,B132,B139,B64,B73,B84,D2
`Chr2:56215252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C79,D11
`Chr2:56215257`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A24,A5,A7,B53,B90,B92,B98,C78
`Chr2:56215268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A14,B80,C71,D5
`Chr2:56215268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B80,C71,D5
`Chr2:56215271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793165.1

208 aa

104

208

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 125-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793165.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	125	184	6.4e-10	39.4	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937182.1
ATGGAGGCTTGTTATATCCCTCAAGGAAGATCAAAGCGGTTTGCTCAACAAGTTTCATATCTTCATCATTTTCGGGCTGATGTGTTTATAGAAGTAATTGATTTACTACTTCAAGAACTTGACAACCGATTTGATGAGGTGAATATGGAGTTGCTCATATGCATGGCTTCATTATATCCTAAAGATGGCTTCTCTTCTTATGACAAGGAAAAGGTACTCAAACTTGCAACTTTTTATCCCTCCGAATTTTCAAGCATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009774
ATGGAGGCTTGTTATATCCCTCAAGGAAGATCAAAGCGGTTTGCTCAACAAGTTTCATATCTTCATCATTTTCGGGCTGATGTGTTTATAGAAGTAATTGATTTACTACTTCAAGAACTTGACAACCGATTTGATGAGGTGAATATGGAGTTGCTCATATGCATGGCTTCATTATATCCTAAAGATGGCTTCTCTTCTTATGACAAGGAAAAGGTACTCAAACTTGCAACTTTTTATCCCTCCGAATTTTCAAGCATTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793165.1
MEACYIPQGRSKRFAQQVSYLHHFRADVFIEVIDLLLQELDNRFDEVNMELLICMASLYPKDGFSSYDKEKVLKLATFYPSEFSSIDLLTLECQLAIFMEDMRRDNEFQNLDDISSLSMKLVETKRHMTYPLVFLLIKLILILPVATASVERVFSGMTYVKNKLRNSMGDQVLNDCLVTFIEKYMFLQVSDDEVVKRFEEMKTRRKIN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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