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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000324`

染色体: Chr01 坐标: 6409298-6410059 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000324`
名称	SmilChr01G000324
描述	uncharacterized SmilChr01G000324
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	6409298 - 6410059 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009789`
GeneID	`131009789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009789`
原始查询	`LOC131009789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793194.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793194.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057793194.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793194.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793194.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:6409302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:6409316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B76,C37
`Chr1:6409358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C67,D5
`Chr1:6409362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C67,D5
`Chr1:6409371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr1:6409374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,C19,D5
`Chr1:6409380`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	46	A14,A21,A22,A24,A5,A8,B106,B107,B114,B117,B120,B130,B15,B25,B37,B46,B47,B51,B59,B61,B74,B78,B8,B80,B81,B82,B92,B93,B95,C10,C17,C24,C28,C31,C32,C34,C42,C47,C53,C60,C61,C68,C82,C84,C85,D4
`Chr1:6409389`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A18,A23,B101,B113,B114,B126,B127,B128,B135,B139,B15,B23,B26,B29,B3,B33,B35,B37,B45,B47,B51,B56,B60,B64,B68,B69,B70,B74,B85,B89,B93,B96,C16,C17,C19,C21,C28,C36,C39,C40,C45,C64,C66,C7,C70,C73,C8,C80,D1,D5
`Chr1:6409405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B66,C19,C39,D5
`Chr1:6409408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B66,C19,C39,D5
`Chr1:6409443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C15
`Chr1:6409497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793194.1

253 aa

126

253

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 52-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793194.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	52	117	3.5e-12	47.2	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937211.1
ATGACTCACCAAGGGACAGAAGGGAGCATGGGAGGAACAAGGATGATAAGCGGGCCAAAACATCGAGGGTCCCCACCACTAGCAAAAAGCCCTTTTTCCGCTGACATCTTGGCGGATACTCTACCACAGAGTTACAAACCTATTTCTATGGATTATGATGGCACCACCGACCCGGAAGTACACCTCAACCGGTTTGAGGGATTAGTCACGCTCCACATGTATACGGAGGGCATCAAGTGCCGGATATTCTCCACCACATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009789
ATGACTCACCAAGGGACAGAAGGGAGCATGGGAGGAACAAGGATGATAAGCGGGCCAAAACATCGAGGGTCCCCACCACTAGCAAAAAGCCCTTTTTCCGCTGACATCTTGGCGGATACTCTACCACAGAGTTACAAACCTATTTCTATGGATTATGATGGCACCACCGACCCGGAAGTACACCTCAACCGGTTTGAGGGATTAGTCACGCTCCACATGTATACGGAGGGCATCAAGTGCCGGATATTCTCCACCACATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793194.1
MTHQGTEGSMGGTRMISGPKHRGSPPLAKSPFSADILADTLPQSYKPISMDYDGTTDPEVHLNRFEGLVTLHMYTEGIKCRIFSTTLTGPAQLWFGMLAPNSIHSFEDLQTRFLRQFASSWRVGKSALSLMDIKQDQNETLREYTARFNLAALEVPEAESQIKNCAYVRGLKPGLFFDELQIRPAMDFDDIMARLPGYSQLEDARMARKAENDKYNAKKAEDAPERYNRNQDRAPFRGLPPRVPPPQAEGPPR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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