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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003882`

染色体: Chr02 坐标: 60884643-60885246 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003882`
名称	SmilChr02G003882
描述	protein G1-like3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60884643 - 60885246 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009832`
GeneID	`131009832`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009832`
原始查询	`LOC131009832`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein G1-like3
产物	protein G1-like3
Arabidopsis	`AT1G07090` (LSH6) LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS-like protein (DUF640) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837220] identity=74; qcov=0.813; evalue=1.21e-50; confidence=medium
Rice	`Os04g0516200` (OsG1L4) - identity=75.5; qcov=0.829; evalue=5.01e-49; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009299 (mRNA transcription); GO:0009416 (response to light stimulus)
KEGG	-
Pfam	PF04852 (ALOG_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009832

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057793221.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793221.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793221.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793221.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793221.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60884979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C64,C66
`Chr2:60885007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B114,B4,B70
`Chr2:60885091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A19,A21,A3,A5,B100,B101,B11,B113,B114,B123,B132,B133,B134,B135,B138,B140,B18,B30,B4,B52,B53,B70,B88,C19,C24,C3,C36,C57,C58,C61,C74,C79,C82,D5,D9
`Chr2:60885105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:60885123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:60885146`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A13,A15,A16,B1,B105,B113,B121,B123,B134,B139,B23,B25,B38,B39,B45,B51,B52,B82,B83,B89,B98,C30,C54,C56,C59,C63,C65,C82,C9,D11,D2
`Chr2:60885150`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B109,B135,B31,B44,B67,C39,D11
`Chr2:60885153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr2:60885155`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B109,B135,B31,B44,B67,C39,D11
`Chr2:60885169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B31,B67,C39
`Chr2:60885203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B44,B67,C39,D10
`Chr2:60885213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793221.1

123 aa

123

ALOG_dom

PF04852 ALOG_dom 21-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793221.1`	Pfam	`PF04852`	ALOG_dom	Domain	21	122	2.7e-45	154.3	ALOG domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937238.1
ATGGCATCCCTAGTGAGCTACTGCAACTCGAGCAGCCCTACATCGGAGACGAGCTCCGTCAGCCAGAAGGCGGTACCTTCGTCCCTGAGCCGGTACGAGTCGCAGAAATGGCGCGACTGGAACACGTCCGGGCGGTATCTGAAGAACCACAAGCCGCCGCTGGTGTTGAGCCATTGTAGCGGGGCCCACATCCTTGAATTCCTCCGCTACCTCGACCAGTTCGGCAAGACCAAGGTCCACACCGCCGGCTGCCCCTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009832
ATGGCATCCCTAGTGAGCTACTGCAACTCGAGCAGCCCTACATCGGAGACGAGCTCCGTCAGCCAGAAGGCGGTACCTTCGTCCCTGAGCCGGTACGAGTCGCAGAAATGGCGCGACTGGAACACGTCCGGGCGGTATCTGAAGAACCACAAGCCGCCGCTGGTGTTGAGCCATTGTAGCGGGGCCCACATCCTTGAATTCCTCCGCTACCTCGACCAGTTCGGCAAGACCAAGGTCCACACCGCCGGCTGCCCCTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793221.1
MASLVSYCNSSSPTSETSSVSQKAVPSSLSRYESQKWRDWNTSGRYLKNHKPPLVLSHCSGAHILEFLRYLDQFGKTKVHTAGCPFFGHPHPLPPCLLRQAWGSLDALIGLLRAAFEENDGRP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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