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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003949`

染色体: Chr02 坐标: 61650183-61650797 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003949`
名称	SmilChr02G003949
描述	uncharacterized SmilChr02G003949
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61650183 - 61650797 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009845`
GeneID	`131009845`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009845`
原始查询	`LOC131009845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Papain family cysteine protease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827311]; symbol=AT4G16190; hit=AT4G16190; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Papain family cysteine protease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827311]; symbol=AT4G16190; hit=AT4G16190; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G16190` (AT4G16190) Papain family cysteine protease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827311] identity=28.6; qcov=0.941; evalue=9.13e-09; confidence=low
Rice	`Os04g0311400` - identity=27.2; qcov=0.936; evalue=6.94e-08; confidence=low
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009845

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793232.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793232.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793232.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793232.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793232.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61650198`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B11,C13,C84
`Chr2:61650198`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B11,C13,C84
`Chr2:61650205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C13,C84
`Chr2:61650211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:61650213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:61650230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C13,C84
`Chr2:61650246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:61650247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:61650252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C13,C84
`Chr2:61650276`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A22,A4,A5,A6,A7,B103,B125,B128,B130,B19,B21,B23,B26,B41,B51,B52,B54,B60,B75,B86,B99,C1,C28,C41,C60,C75
`Chr2:61650279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:61650290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793232.1

204 aa

102

204

Peptidase_C1

PF00112 Peptidase_C1 42-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793232.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	42	184	2.6e-14	54.6	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937249.1
ATGGCTACCGGCGAGATGGTTAAATGCACTGAGCAAGAGTGCATAGATTTTGTATATAAGGCGATGCCATCTTCTTTAGAGTTTGATGACGATGGTAACATGCTTGAACCTGGCAGAGAAGGCTCAGGCCAACAATTAGCGGACGCGTTTGACTATCTAGAACTGTTTGGGCTGCTACGAGAATCGGACTATCGGTTTCTCGGTCAAAGGAGACTTGTGGATTGGAGTGAGCGGCCAGTGGGGATGCCAAGAATTTATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009845
ATGGCTACCGGCGAGATGGTTAAATGCACTGAGCAAGAGTGCATAGATTTTGTATATAAGGCGATGCCATCTTCTTTAGAGTTTGATGACGATGGTAACATGCTTGAACCTGGCAGAGAAGGCTCAGGCCAACAATTAGCGGACGCGTTTGACTATCTAGAACTGTTTGGGCTGCTACGAGAATCGGACTATCGGTTTCTCGGTCAAAGGAGACTTGTGGATTGGAGTGAGCGGCCAGTGGGGATGCCAAGAATTTATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793232.1
MATGEMVKCTEQECIDFVYKAMPSSLEFDDDGNMLEPGREGSGQQLADAFDYLELFGLLRESDYRFLGQRRLVDWSERPVGMPRIYIMDYLWIEDHRDDTIRQMLEMKGPLVARITSFPDFYYWSDEDEVFIGPEYEYEYFEDYSMHVVLIVGYGEQDETPYYIIKNSYRTDSGHKGYAKIHRRLIHNYEALYGPSDTYMIDPQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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