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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003385`

染色体: Chr01 坐标: 52531264-52532222 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003385`
名称	SmilChr01G003385
描述	uncharacterized SmilChr01G003385
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52531264 - 52532222 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009855`
GeneID	`131009855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009855`
原始查询	`LOC131009855`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=36.5; qcov=0.831; evalue=5.54e-22; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=39.4; qcov=1.18; evalue=4.7e-60; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009855

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793245.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793245.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793245.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793245.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793245.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52531268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C61,C78
`Chr1:52531288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B5,C41,C70,D4
`Chr1:52531297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B5,C41
`Chr1:52531297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C41
`Chr1:52531327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B105,B118,B4,B68,B69,C36,C42
`Chr1:52531332`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	B128,B134,B135,B138,B14,B17,B26,B49,B53,B78,B86,B99,C39,C78,D5
`Chr1:52531363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B44,B70,C28,C53
`Chr1:52531369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:52531372`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B60,B66,B98,C60
`Chr1:52531372`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B60,B66,B98,C60
`Chr1:52531385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C62,C70
`Chr1:52531385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793245.1

267 aa

134

267

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 58-96 aa PF04827 Plant_tran 147-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793245.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	58	96	3.1e-19	69.2	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057793245.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	147	267	2.6e-50	171.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937262.1
ATGTCTTTCTCTTCACCAAGCCACGATGATGAGCGACGTGCTCAAGAATTTTCCAATCTTGTGCAAGAATTTAATCAAATTGTTCAAGCTATTGGCGATCCGGATGCGCAACCTCGTCGGTGGCGACGAAGAGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCATCGGGACCGTGAAGCCGGCGCTCTACGTTTGCACGCGGATTACTTTGCTGAAAATTCGGTCTACCCCGACAATGTCTTCCGCCGCCGATTTTGCATGCGTCGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009855
ATGTCTTTCTCTTCACCAAGCCACGATGATGAGCGACGTGCTCAAGAATTTTCCAATCTTGTGCAAGAATTTAATCAAATTGTTCAAGCTATTGGCGATCCGGATGCGCAACCTCGTCGGTGGCGACGAAGAGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCATCGGGACCGTGAAGCCGGCGCTCTACGTTTGCACGCGGATTACTTTGCTGAAAATTCGGTCTACCCCGACAATGTCTTCCGCCGCCGATTTTGCATGCGTCGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793245.1
MSFSSPSHDDERRAQEFSNLVQEFNQIVQAIGDPDAQPRRWRRRVAKKAYIHRDREAGALRLHADYFAENSVYPDNVFRRRFCMRRALFLRIVNAVASDPYFQQRTDALGRPGFMPLQKCTILSSHYSPLRCRILEEADYQRLLAMHENCPTAWQDAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGSNNDINVLNNSTLFNDRLQGMGVPVTYQVNNAYYTSEYYLTDGIYPNWPVFVKSPTHPTDSKGKRFKVMQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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