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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004015`

染色体: Chr02 坐标: 62450744-62453944 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004015`
名称	SmilChr02G004015
描述	uncharacterized SmilChr02G004015
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62450744 - 62453944 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009856`
GeneID	`131009856`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009856`
原始查询	`LOC131009856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009856

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793243.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057793243.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057793243.1`
4	PML body	PML body	0.40000	`XP_057793243.1`
5	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793243.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62451263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C56
`Chr2:62451298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:62451303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:62451313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C42,C63
`Chr2:62451314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B69
`Chr2:62451320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A8,B49,B64,C45
`Chr2:62451325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C60
`Chr2:62451325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:62451334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:62451362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B136
`Chr2:62451379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:62451393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B64,B69,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793243.1

871 aa

436

871

DUF1985

Peptidase_C48

PF09331 DUF1985 3-125 aa PF02902 Peptidase_C48 720-859 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793243.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	3	125	3.6e-09	37.5	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057793243.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	720	859	1.1e-05	26.1	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937260.1
GGTATTCATTTTGTAAATGAATAGGCGAATGTCCCATATCTTCGTCGCGACACTATAGACCAGACGGAGGTTGCTATCAGCACCTACTATAGGGATTCACATTTTCCGGAGCTGGTTGAAACTTTAAATGTGGTCGGCGAACAGTGCAATTCAGATTTATTGGGAAGATTTAGAGCATCATGTTTTGGGCATTTCACTGATTGGAGGCCCGGCGCGAAGAGCAATAAAGCATTACACCAGATTGTATCGAGGCAGATTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009856
ATGTGCTTCTTTCTGTGCGGAGCACGAGTCAGATTTTCTCCTGCGGACTACGCATTAGTGACTGGGCTCAATTTCGGGGGATCGAGGTTCGATGCGACATTACAGCACGACTGCAGTCGCGTGGAGGCATACCGACGATTCTGCGGTGCGCGAAGCATGACCATACAGTCGCTCATCAAACGCGTGTGCGATTTGGATCGTCGAGTGGATGATGAGGATGGGAGCCTGTACCTTCGTGCTGTCCTCGTGTGTGTGGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793243.1
MCFFLCGARVRFSPADYALVTGLNFGGSRFDATLQHDCSRVEAYRRFCGARSMTIQSLIKRVCDLDRRVDDEDGSLYLRAVLVCVAHTLVLGLDARVQPWLWVLVDDLAAFDRFPWGAYSYKMLCHYTRETGKGEKYHFYGPSWALYVWALERVPGFGHMVAASSGDPTAHPRCLRWTFRGKPKLHGLRDLFEGQGGVMPLDPDADDLSSHYFISALTPGELSVSFRPPDNPLARGVQFPQGTGARVVEERGDEEDVPRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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