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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003391`

染色体: Chr01 坐标: 52629068-52631558 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003391`
名称	SmilChr01G003391
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52629068 - 52631558 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009868`
GeneID	`131009868`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009868`
原始查询	`LOC131009868`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=41.7; qcov=0.392; evalue=6e-34; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=51.3; qcov=0.9; evalue=1.61e-135; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009868

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793257.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057793257.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793257.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793257.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52630104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B2,B68
`Chr1:52630117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C76,D8
`Chr1:52630124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:52630136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B108,B111,B126,B63,C1,C41,C51,C57,D10
`Chr1:52630170`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	B102,B106,B107,B111,B138,B20,B28,B33,B40,B6,B64,B66,B74,B79,B81,B91,C18,C24,C26,C28,C29,C33,C34,C44,C72,C84,D2,D7
`Chr1:52630183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:52630195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B65
`Chr1:52630207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:52630223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C12
`Chr1:52630244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr1:52630255`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B94,C80
`Chr1:52630255`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B94,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793257.1

429 aa

214

429

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 43-81 aa PF04827 Plant_tran 150-353 aa PF13359 DDE_Tnp_4 196-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793257.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	43	81	1.1e-18	67.4	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057793257.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	150	353	7e-92	307.4	Plant transposon protein
`XP_057793257.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	196	344	1.2e-06	29.0	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937274.1
ATGGGCACCTCTAATATTTGTCTACATTTTCATGAGGTGAATGATATTGGTGATCCGGATGTGCAACCTCGTCGGCGGCGACGAAGAGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCATCGGGACCGTGAAGCCGGCGCTCTACGTTTGCACGCGGATTACTTTGCTGAAAATCCGGTCTACCCCGACAACGTCTTCCACCGCCGATTTCTCATGCGTCGTGCGTTGTTTTTGCGTATCGTTAATGCCGTCGCATCCGATCCATACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009868
ATGGGCACCTCTAATATTTGTCTACATTTTCATGAGGTGAATGATATTGGTGATCCGGATGTGCAACCTCGTCGGCGGCGACGAAGAGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCATCGGGACCGTGAAGCCGGCGCTCTACGTTTGCACGCGGATTACTTTGCTGAAAATCCGGTCTACCCCGACAACGTCTTCCACCGCCGATTTCTCATGCGTCGTGCGTTGTTTTTGCGTATCGTTAATGCCGTCGCATCCGATCCATACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793257.1
MGTSNICLHFHEVNDIGDPDVQPRRRRRRVAKKAYIHRDREAGALRLHADYFAENPVYPDNVFHRRFLMRRALFLRIVNAVASDPYFQQRTDALGRPDFTPLQKCTVVVRMLANGGAADQYDEYLQIAESTLLECLRRFCRAIIHLFGAEYLRRPTSADCQRLLAMHEAKHGFPGMLGSLDCMHWSWKNCPMAWQGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGTPDSNNDINVLNNSTFFNDRLQGMGVPVTYQVNN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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