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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004147`

染色体: Chr02 坐标: 63789223-63790250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004147`
名称	SmilChr02G004147
描述	uncharacterized SmilChr02G004147
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63789223 - 63790250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009877`
GeneID	`131009877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009877`
原始查询	`LOC131009877`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=28; qcov=0.687; evalue=4.07e-13; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF08284 (RVP_2); PF09668 (Asp_protease); PF13650 (Asp_protease_2); PF13975 (gag-asp_proteas); PF30863 (PRO_PEG10-RTL1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793263.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793263.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793263.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057793263.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793263.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63789336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr2:63789344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B67
`Chr2:63789348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:63789583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B11,B35,C26
`Chr2:63789590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B100,B35,C26
`Chr2:63789590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B35,C26
`Chr2:63789615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793263.1

275 aa

138

275

zf-CCHC

gag-asp_proteas

Asp_protease_2

Asp_protease

RVP_2

PRO_PEG10-RTL1

PF00098 zf-CCHC 54-70 aa PF13975 gag-asp_proteas 82-165 aa PF13650 Asp_protease_2 83-162 aa PF09668 Asp_protease 83-168 aa PF08284 RVP_2 83-182 aa PF30863 PRO_PEG10-RTL1 83-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793263.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	54	70	4.5e-05	24.0	Zinc knuckle
`XP_057793263.1`	Pfam	`PF13975`	gag-asp_proteas	Domain	82	165	1.9e-09	38.6	gag-polyprotein putative aspartyl protease
`XP_057793263.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	83	162	4.5e-08	34.4	Aspartyl protease
`XP_057793263.1`	Pfam	`PF09668`	Asp_protease	Domain	83	168	1.2e-06	29.4	Aspartyl protease
`XP_057793263.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	83	182	7.8e-23	81.5	Retroviral aspartyl protease
`XP_057793263.1`	Pfam	`PF30863`	PRO_PEG10-RTL1	Domain	83	182	2.1e-12	48.2	PEG10/RTL1 protease domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937280.1
ATGGGTGGAAACCCTGGAAATGGAAATGGATTTGGAAAGAAACCATGGGCTGCCAACCAAAATCAGAATCAGCCTCAGAACCAACAGCATCAAGCAATTATAAAAACACCTTGCCCAAAGTGTCAGAAACTCCATCTGGGAGAATGCCTGAGAGGAATGAATGTCTGCTTTACATGCGGAGAAACTGGGCACTATGCTCCGGCATGTCCAAGGAAGAGAGGAGGAGCACCGCAACAGCCACAGAACCAGGCTTTGTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009877
ATGGGTGGAAACCCTGGAAATGGAAATGGATTTGGAAAGAAACCATGGGCTGCCAACCAAAATCAGAATCAGCCTCAGAACCAACAGCATCAAGCAATTATAAAAACACCTTGCCCAAAGTGTCAGAAACTCCATCTGGGAGAATGCCTGAGAGGAATGAATGTCTGCTTTACATGCGGAGAAACTGGGCACTATGCTCCGGCATGTCCAAGGAAGAGAGGAGGAGCACCGCAACAGCCACAGAACCAGGCTTTGTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793263.1
MGGNPGNGNGFGKKPWAANQNQNQPQNQQHQAIIKTPCPKCQKLHLGECLRGMNVCFTCGETGHYAPACPRKRGGAPQQPQNQALFDTGASHSFISHAACKRLELTPQLAETTLEVSTPGGGRLAIKDVISNLELNIGAETFKAELYVIAIIDFDMILGMDWLTQVGATILCNERKISFQSAGKEKASFHGIRMGERVPVISAMKAMKMIRKGKCQAFLVSLTGEHEVEKMIEEVCVVREFKDIFPEELPGLPPDRQLEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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